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Les maladies infectieuses sont toujours les principales causes de mortalité et d'invalidité (perte d'années de vie productive) dans le monde. En 2016, sur un total de 56,4 millions de décès dans le monde, 33% étaient dus à des maladies infectieuses, 30% à des maladies cardiovasculaires et 10% à des cancers. La lutte contre les maladies se positionne sur deux fronts simultanés: les maladies infectieuses et les maladies chroniques non transmissibles.

Si l'on regarde les chiffres, parmi les 17,3 millions de personnes décédées d'une infection en 2016, les causes de décès les plus fréquentes étaient les infections des voies respiratoires inférieures (3,7 millions), le paludisme (2,2 millions), la tuberculose (1,3 million), la diarrhée (1,4 million) et l'infection par le HIV/SIDA (1,1 million). Les facteurs les plus importants à considérer en lien avec les maladies infectieuses sont la démographie et le comportement humains, le développement technologique et industriel, le développement économique et les variations de l'utilisation des sols, les voyages et les échanges intercontinentaux, les changements climatiques, l'adaptation microbienne elle-même et, enfin, la disparition ou la réduction de certaines mesures de santé publique efficaces.

Ces facteurs, qui interagissent les uns avec les autres, signifient qu'aucune partie du globe ne doit être considérée comme isolée du reste du monde, et que l'émergence, la réémergence ou la propagation de maladies infectieuses importées ou apparemment éradiquées ne doivent pas être considérée comme impossible.

La situation épidémiologique internationale complexe de ce siècle, qui est illustrée par la dissémination délibérée de spores de Bacillus Anthracis comme arme de bioterrorisme et afin de provoquer l'anthrax pulmonaire chez les victimes qui les inhalent ; l'émergence du virus du Nil Occidental en tant qu'agent pathogène aux États-Unis ; l'épidémie du Syndrome Respiratoire Aigu Sévère (SRAS); la propagation zoonotique de la Variole du Singe aux États-Unis, la menace d'une pandémie de Grippe, l'épidémie d'Ebola en Afrique, l'apparition de cas de fièvre jaune en Angola, combinée à la réémergence de la Dengue et du Choléra; l'émergence de nouvelles arboviroses dans la région des Amériques, tels que le Chikungunya et plus récemment le Zika, auxquels s'ajoute la morbidité due à d'autres maladies infectieuses endémiques, telles que le VIH/SIDA, la Leptospirose, la Tuberculose, la Pneumonie communautaire et l'augmentation de la résistance aux antibiotiques avec le développement de bactéries multirésistantes. Tous ces éléments mettent en évidence la nécessité sans précédent, de perfectionner le processus de spécialisation et d'amélioration du capital humain, afin d'accroître la compétence et les performances de tout le personnel nécessaire pour relever les défis du contrôle et de la gestion des urgences biologiques, hospitalières et de santé publique, qui garantissent la qualité et la sécurité des soins de santé pour la population dans n'importe où dans le monde.  

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Module 1. Diagnostic microbiologique et autres tests pour les maladies infectieuses

1.1. Organisation, structure et fonctionnement du laboratoire de microbiologie

1.1.1. Organisation et structure du laboratoire de microbiologie
1.1.2. Fonctionnement d'un laboratoire de microbiologie

1.2. Principes d'utilisation des examens microbiologiques chez les patients atteints de pathologies infectieuses Le processus d'échantillonnage

1.2.1. Le rôle des études microbiologiques dans le diagnostic des maladies infectieuses
1.2.2. Le processus de collecte des échantillons microbiologiques: étapes pré-analytiques, analytiques et post-analytiques
1.2.3. Exigences d'échantillonnage pour les principales études microbiologiques utilisées dans la pratique clinique quotidienne: études du sang, de l'urine, des selles, de la salive

1.3. Études virologiques

1.3.1. Les types de virus et leurs caractéristiques générales
1.3.2. Caractéristiques générales des études virologiques
1.3.3. Culture virale
1.3.4. Études du génome viral
1.3.5. Études sur les antigènes et les anticorps contre les virus

1.4. Études bactériologiques

1.4.1. Classification des bactéries
1.4.2. Caractéristiques générales des études bactériologiques
1.4.3. Colorants pour l'identification des bactéries
1.4.4. L'étude des antigènes bactériens
1.4.5. Méthodes de culture: générales et spécifiques
1.4.6. Bactéries nécessitant des méthodes d'étude spéciales

1.5. Études mycologiques

1.5.1. Classification des champignons
1.5.2. Principales études mycologiques

1.6. Études parasitologiques

1.6.1. Classification des parasites
1.6.2. Études sur les protozoaires
1.6.3. Études sur les helminthes

1.7. Interprétation correcte des études microbiologiques

1.7.1. Relation entre la microbiologie clinique et l'interprétation des études microbiologiques

1.8. Lecture interprétée de l'antibiogramme

1.8.1. Interprétation traditionnelle de l'antibiogramme en relation avec la sensibilité aux antimicrobiens et la résistance aux antimicrobiens
1.8.2. Lecture interprétée de l'antibiogramme: paradigme actuel

1.9. Utilité de la carte microbienne d'une institution

1.9.1. Quelle est la carte microbienne d'une institution?
1.9.2. Applicabilité clinique de la carte microbienne

1.10. Biosécurité

1.10.1. Définitions conceptuelles de la biosécurité
1.10.2. Pertinence de la biosécurité pour les services de santé
1.10.3. Mesures de précaution universelles
1.10.4. Gestion des déchets biologiques dans un établissement de soins de santé

1.11. Le laboratoire clinique dans l'étude des maladies infectieuses

1.11.1. Réacteurs de phase aiguë
1.11.2. Études de la fonction hépatique, du milieu interne, de la coagulation et de la fonction rénale dans le sepsis
1.11.3. L'étude des fluides inflammatoires dans le diagnostic des infections
1.11.4. Biomarqueurs, utilité en pratique clinique

1.12. Études d'imagerie pour le diagnostic de la pathologie infectieuse

1.12.1. Le rôle des études d'imagerie chez les patients atteints de maladies infectieuses
1.12.2. Le rôle de l'échographie dans l'évaluation complète du patient atteint de sepsis

1.13. Le rôle des études génétiques immunologiques

1.13.1. Études des maladies génétiques et de leur prédisposition aux maladies infectieuses
1.13.2. Études immunologiques chez les patients immunodéprimés

1.14. Utilité des études d'anatomie pathologique

1.14.1. Modifications des études cytologiques en fonction du type d'agent biologique
1.14.2. La nécropsie et son importance dans la mortalité infectieuse

1.15. Évaluation de la gravité des maladies infectieuses

1.15.1. Échelles de pronostic dans la prise en charge des patients atteints de maladies infectieuses basées sur des études de laboratoire et des éléments cliniques
1.15.2. SOFA, utilité aujourd'hui: composantes du SOFA, ce qu'il mesure Utilité pour l'évaluation des patients
1.15.3. Principales complications des maladies infectieuses

1.16. Campagne Mondiale contre la Sepsis

1.16.1. Émergence et évolution
1.16.2. Objectifs
1.16.3. Recommandations et impacts

1.17. Bioterrorisme

1.17.1. Principaux agents infectieux utilisés pour le bioterrorisme
1.17.2. Réglementation internationale sur la manipulation des spécimens biologiques

Module 2. Le système immunitaire et les infections chez l'hôte immunodéprimé

2.1. Structure et développement du système immunitaire

2.1.1. Composition et développement du système immunitaire
2.1.2. Organes du système immunitaire
2.1.3. Cellules du système immunitaire
2.1.4. Médiateurs chimiques du système immunitaire

2.2. Réponse immunitaire aux infections virales et bactériennes

2.2.1. Principales cellules impliquées dans la réponse immunitaire contre les virus et les bactéries
2.2.2. Principaux médiateurs chimiques

2.3. Réponse immunitaire aux infections fongique et parasitaires

2.3.1. Réponse immunitaire contre les champignons filamenteux et les levures
2.3.2. Réponse immunitaire contre les protozoaires
2.3.3. Réponse immunitaire contre les helminthes

2.4. Manifestations cliniques les plus courantes de l'immunosuppression

2.4.1. Types d'immunosuppression
2.4.2. Manifestations cliniques en fonction de agent infectieux
2.4.3. Infections courantes selon le type d'immunosuppression
2.4.4. Infections fréquentes chez les patients immunodéprimés en fonction du système organique concerné

2.5. Syndrome fébrile chez les patients neutropéniques

2.5.1. Manifestations cliniques les plus fréquentes
2.5.2. Agents infectieux les plus couramment diagnostiqués
2.5.3. Études complémentaires les plus couramment utilisées dans l'évaluation complète du patient neutropénique fébrile
2.5.4. Recommandations thérapeutiques

2.6. Prise en charge des patients immunodéprimés présentant une septicémie

2.6.1. Évaluation du diagnostic, du pronostic et du traitement selon les dernières recommandations internationales étayées par des preuves scientifiques

2.7. Traitement immunomodulateur et immunosuppresseur

2.7.1. Immunomodulateurs, leur utilisation clinique
2.7.2. Immunosuppresseurs, leur relation avec la septicémie

Module 3. Éléments généraux des maladies infectieuses

3.1. Concepts généraux et fondamentaux du processus maladies infectieuses-santé

3.1.1. Les étapes du processus infectieux
3.1.2. La réponse inflammatoire systémique
3.1.3. La septicémie
3.1.4. Complications de la septicémie

3.2. Symptômes et signes les plus courants chez les patients atteints de maladies infectieuses

3.2.1. Symptômes et signes locaux de la septicémie
3.2.2. Symptômes et signes systémiques de la septicémie

3.3. Principaux syndromes infectieux

3.3.1. Syndromes systémiques
3.3.2. Syndromes locaux

3.4. Fièvre d'origine indéterminée (FUO)

3.4.1. FUO classique
3.4.2. FOI nosocomiale
3.4.3. FUO chez les immunodéprimés
3.4.4. FUO et infection par le VIH

3.5. Fièvre et exanthème

3.5.1. Types d'exanthème
3.5.2. Principaux agents infectieux à l'origine de l'exanthème

3.6. Fièvre et adénomégalie

3.6.1. Caractéristiques de l'adénomégalies infectieuses
3.6.2. Infections et adénomégalies localisées
3.6.3. Infections et adénomégalies généralisées

3.7. Infections sexuellement transmissibles (IST)

3.7.1. Épidémiologie des ITS
3.7.2. Principaux agents sexuellement transmissibles
3.7.3. Approche syndromique des IST

3.8. Choc septique

3.8.1. Épidémiologie
3.8.2. Physiopathologie
3.8.3. Manifestations cliniques et caractéristiques distinctives des autres types de chocs
3.8.4. Diagnostic et évaluation de la gravité et des complications
3.8.5. Prise en charge thérapeutique

Module 4. Le rôle de l'infectiologue dans les services de santé

4.1. L'infectiologie et son importance pour les soins médicaux dans le domaine de toute spécialité

4.1.1. L'universalité de la pathologie infectieuse dans les spécialités médicales
4.1.2. La maîtrise de la thérapeutique antibiotique

4.2. Compétences et aptitudes du pathologiste infectieux

4.2.1. Compétences de l'infectiologue
4.2.2. Compétences de l'infectiologue

4.3. Rôles de l'infectiologue dans l'équipe soignante

4.3.1. Rôles de l'infectiologue dans l'équipe de soins à différents niveaux du système de santé

4.4. Interconsultation pour les maladies infectieuses

4.4.1. Fonctions de la consultation en matière de maladies infectieuses
4.4.2. Pathologies à consulter

4.5. La mise à jour scientifique du médecin spécialiste des maladies infectieuses et les défis futurs de l'infectiologie

4.5.1. Auto-préparation
4.5.2. Formation et développement professionnel
4.5.3. Défis futurs pour les maladies infectieuses: émergence de nouvelles maladies Résistance aux antimicrobiens Développement de vaccins et d'antibiotiques

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