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Módulo 1. Biologia molecular

1.1. Mecanismos moleculares do cancro

1.1.1. Ciclo celular
1.1.2. Destacamento de células tumorais

1.2. Reprogramação do microambiente tumoral

1.2.1. O microambiente tumoral: uma visão geral
1.2.2. O TME como um fator prognóstico no cancro de pulmão
1.2.3. O TME na progressão e metástase do cancro de pulmão

1.2.3.1. Fibroblastos associados ao cancro (CAF)
1.2.3.2. Células endoteliais
1.2.3.3. Hipoxia no cancro de pulmão
1.2.3.4. Inflamação
1.2.3.5. Células imunológicas

1.2.4. Contribuição do TME na resistência terapêutica

1.2.4.1. Contribuição do TME na resistência à radioterapia

1.2.5. O TME como um alvo terapêutico no cancro de pulmão

1.2.5.1. Direções futuras

1.3. Imunologia tumoral: a base da imunoterapia oncológica

1.3.1. Introdução ao sistema imunológico
1.3.2. Imunologia tumoral

1.3.2.1. Antígenos associados aos tumores
1.3.2.2. Identificação de antígenos associados aos tumores
1.3.2.3. Tipos de antígenos associados aos tumores

1.3.3. Fundamentos da imunoterapia contra o cancro

1.3.3.1. Introdução às abordagens imunoterapêuticas
1.3.3.2. Anticorpos monoclonais na terapia do cancro

1.3.3.2.1. Produção de anticorpos monoclonais
1.3.3.2.2. Tipos de anticorpos terapêuticos
1.3.3.2.3. Mecanismos de ação dos anticorpos
1.3.3.2.4. Anticorpos modificados

1.3.4. Moduladores imunes não específicos

1.3.4.1. Bacilo de Calmette Guérin
1.3.4.2. Interferon-α
1.3.4.3. Interleucina-2
1.3.4.4. Imiquimode

1.3.5. Outras abordagens da imunoterapia

1.3.5.1. Vacinas contra células dendríticas
1.3.5.2. Sipuleucel-T
1.3.5.3. Bloqueio CTLA-4
1.3.5.4. Terapia de células T adotivas

1.3.5.4.1. Terapia celular adotiva com clones de células T
1.3.5.4.2. Terapia celular adotiva com linfócitos infiltrantes tumorais

1.4. Mecanismos moleculares envolvidos no processo de invasão e metástase

Módulo 2 Oncologia genómica ou de precisão

2.1. Utilidade do perfil de expressão génica no cancro
2.2. Subtipos moleculares do cancro de mama
2.3. Plataformas genómicas prognósticas-preditivas no cancro de mama
2.4. Alvos terapêuticos no cancro de pulmão de células não pequenas

2.4.1. Introdução
2.4.2. Técnicas de deteção molecular
2.4.3. Mutação EGFR
2.4.4. Translocação ALK
2.4.5. Translocação ROS
2.4.6. Mutação BRAF
2.4.7. Rearranjos dos NRTK
2.4.8. Mutação HER2
2.4.9. Mutação/Amplificação de MET
2.4.10. Rearranjos do RET
2.4.11. Outros alvos moleculares2.5. Classificação molecular do cancro do cólon

2.6. Estudos moleculares em cancro gástrico

2.6.1. Tratamento do cancro gástrico avançado
2.6.2. Superexpressão do HER2 em cancro gástrico avançado
2.6.3. Determinação e interpretação da superexpressão do HER2 em cancro gástrico avançado
2.6.4. Medicamentos com atividade direcionada ao HER2
2.6.5. Trastuzumab de primeira linha no cancro gástrico avançado

2.6.5.1. Tratamento do cancro gástrico avançado HER2+ após a progressão para regimes baseados em trastuzumab

2.6.6. Atividade de outros medicamentos anti-HER2 no cancro gástrico avançado

2.7. GIST como modelo para a pesquisa translacional: 15 anos de experiência

2.7.1. Introdução
2.7.2. Mutações do KIT e PDGFRA como principais promotores no GIST
2.7.3. Genótipo em GIST: valor prognóstico e preditivo
2.7.4. Genótipo em GIST e resistência imatinibe
2.7.5. Conclusões

2.8. Biomarcadores moleculares e genómicos no melanoma
2.9. Classificação molecular dos tumores cerebrais
2.10. Biomarcadores moleculares e genómicos no melanoma
2.11. Imunoterapia e biomarcadores

2.11.1. O cenário das terapias imunológicas no tratamento do cancro e a necessidade de definir o perfil mutacional de um tumor
2.11.2. Biomarcadores de inibidor de ponto de controlo: PD-L1 e mais

2.11.2.1. O papel da PD-L1 na regulamentação imunológica
2.11.2.2. Dados de ensaios clínicos e biomarcador PD-L1
2.11.2.3. Os limites e ensaios para a expressão PD-L1: um quadro complexo
2.11.2.4. Biomarcadores emergentes

2.11.2.4.1. Carga Mutacional Tumoral (TMB)

2.11.2.4.1.1. Quantificação da carga mutacional tumoral
2.11.2.4.1.2. Evidência da carga mutacional tumoral
2.11.2.4.1.3. A carga mutacional tumoral como um biomarcador preditivo
2.11.2.4.1.4. A carga como um biomarcador prognóstico
2.11.2.4.1.5. O futuro da carga mutacional

2.11.2.4.2. Instabilidade dos microssatélites
2.11.2.4.3. Análise de infiltração imune
2.11.2.4.4. Marcadores de toxicidade

2.11.3. Desenvolvimento de medicamentos de ponto de controlo imunológico no cancro
2.11.4. Medicamentos disponíveis

Módulo 3. Mudanças na prática clínica atual e novas aplicações com a oncológia genómica

3.1. Biópsias líquidas: moda ou futuro?

3.1.1. Introdução
3.1.2. Células tumorais circulantes
3.1.3. ctDNA
3.1.4. Utilidades clínicas
3.1.5. Limitações do ctDNA
3.1.6. Conclusões e Futuro

3.2. O papel do Biobanco na Investigação Clínica

3.2.1. Introdução
3.2.2. Vale a pena o esforço para montar um Biobanco?
3.2.3. Como começar a criar um Biobanco?
3.2.4. Consentimento informado para o Biobanco
3.2.5. Coleta de amostras para Biobanco
3.2.6. Controlo de Qualidade
3.2.7. Acesso às amostras

3.3. Ensaios clínicos: novos conceitos baseados na medicina de precisão

3.3.1. O que são ensaios clínicos? Como se diferenciam de outros tipos de pesquisa?

3.3.1.1. Tipos de ensaios clínicos

3.3.1.1.1. De acordo com os seus objetivos
3.3.1.1.2. De acordo com o número de centros participantes
3.3.1.1.3. De acordo com a metodologia
3.3.1.1.4. De acordo com o grau de mascaramento

3.3.2. Resultados de ensaios clínicos em oncologia torácica

3.3.2.1. Relacionado ao tempo de sobrevivência
3.3.2.2. Resultados relacionados a tumores
3.3.2.3. Resultados relatados pelos pacientes

3.3.3. Ensaios clínicos na era da medicina de precisão

3.3.3.1. Medicina de precisão
3.3.3.2. Terminologia relacionada ao desenho de ensaios na era da medicina de precisão

3.4. Incorporação de marcadores acionáveis na prática clínica
3.5. Aplicação da genómica na prática clínica por tipo de tumor
3.6. Sistemas de apoio à tomada de decisão em oncologia baseados em Inteligência Artificial

Módulo 4. Uso de Unix e Linux na bioinformática

4.1. Introdução ao sistema operativo Linux

4.1.1. O que é um sistema operativo?
4.1.2. Os benefícios do uso do Linux

4.2. Ambiente Linux e instalação 

4.2.1. Distribuições Linux
4.2.2. Instalação do Linux usando um dispositivo USB
4.2.3. Instalação do Linux usando CD-ROM
4.2.4. Instalação do Linux usando uma máquina virtual

4.3. A linha de comando

4.3.1. Introdução
4.3.2. O que é uma linha de comando?
4.3.3. Trabalhando no terminal
4.3.4. O Shell, Bash

4.4. Navegação básica

4.4.1. Introdução
4.4.2. Como saber a localização atual?
4.4.3. Rotas absolutas e relativas
4.4.4. Como nos movemos no sistema?

4.5. Manipulação de arquivos

4.5.1. Introdução
4.5.2. Como construímos um diretório?
4.5.3. Como mudar para um diretório?
4.5.4. Como criar um arquivo vazio?
4.5.5. Copiar um arquivo e diretório
4.5.6. Eliminar um arquivo e diretório

4.6. Editor de texto Vi

4.6.1. Introdução
4.6.2. Como salvar e sair?
4.6.3. Como navegar por um arquivo no editor de texto Vi?
4.6.4. Apagando o conteúdo
4.6.5. O comando desfazer

4.7. Wilds

4.7.1. Introdução
4.7.2. O que são wilds?
4.7.3. Exemplos de wilds

4.8. Autorizações

4.8.1. Introdução
4.8.2. Como visualizar as permissões de um arquivo?
4.8.3. Como alterar as permissões?
4.8.4. Definições de permissões
4.8.5. Permissões para diretórios
4.8.6. O utilizador "root”

4.9. Filtros

4.9.1. Introdução
4.9.2. Head
4.9.3. Tail
4.9.4. Sort
4.9.5. nl
4.9.6. wc
4.9.7. cut
4.9.8. sed
4.9.9. uniq
4.9.10. tac
4.9.11. Outros filtros

4.10. Grep e expressões regulares

4.10.1. Introdução
4.10.2.
4.10.3. Expressões regulares
4.10.4. Alguns exemplos

4.11. Canalização e Redirecionamentos

4.11.1. Introdução
4.11.2. Redirecionamento para um arquivo
4.11.3. Salvar num arquivo
4.11.4. Redirecionamento a partir de um arquivo
4.11.5. Redirecionamento STDERR
4.11.6. Canalização (Pipelines)

4.12. Gestão de processos

4.12.1. Introdução
4.12.2. Processos ativos
4.12.3. Encerrar um processo corrompido
4.12.4. Trabalho de primeiro e segundo plano

4.13. Bash

4.13.1. Introdução
4.13.2. Pontos importantes
4.13.3. “Porquê ele”?
4.13.4. Variáveis
4.13.5. As declarações

Módulo 5. Análise de dados em projetos de Big Data: linguagem de programação R

5.1. Introdução à linguagem de programação R

5.1.1. O que é R?
5.1.2. Instalação do R e da interface gráfica R
5.1.3. Pacotes

5.1.3.1. Pacotes standard
5.1.3.2. Pacotes contribuídos e CRAN

5.2. Características básicas do R

5.2.1. O ambiente R
5.2.2. Software e documentação relacionados
5.2.3. R e estatísticas
5.2.4. R e o sistema de janelas
5.2.5. Usando R interativamente
5.2.6. Uma sessão introdutória
5.2.7. Obtendo ajuda com funções e características
5.2.8. Comandos R, sensibilidade a maiúsculas, entre outros.
5.2.9. Recuperação e correção de comandos anteriores
5.2.10. Executar comandos ou desviar a saída para um arquivo
5.2.11. Permanência de dados e eliminação de objetos

5.3. Tipos de objetos R

5.3.1. Manipulações simples; números e vetores

5.3.1.1. Vetores e atribuições
5.3.1.2. Aritmética vetorial
5.3.1.3. Gerando sequências regulares
5.3.1.4. Vetores lógicos
5.3.1.5. Valores Perdidos
5.3.1.6. Vetores de caracteres
5.3.1.7. Vetores de índice

5.3.1.7.1. Seleção e modificação de subconjuntos de um conjunto de dados

5.3.1.8. Outros tipos de objetos

5.3.2. Objetos, modos e atributos

5.3.2.1. Atributos intrínsecos: modo e comprimento
5.3.2.2. Mudando o comprimento de um objeto
5.3.2.3. Coleta e configuração de atributos
5.3.2.4. A classe de um objeto

5.3.3. Fatores ordenados e não ordenados

5.3.3.1. Um exemplo específico
5.3.3.2. A função tapply () e as matrizes desiguais
5.3.3.3. Fatores ordenados

5.3.4. Matrizes

5.3.4.1. Matrizes
5.3.4.2. Indexação de matrizes. Subsecções de uma matriz
5.3.4.3. Matrizes do índice
5.3.4.4. A função array ()
5.3.4.5. Aritmética mista de vetor e matriz. A regra da reciclagem
5.3.4.6. O produto externo de duas matrizes
5.3.4.7. Transposição de matriz generalizada
5.3.4.8. Multiplicação de matrizes
5.3.4.9. Valores próprios e vetores próprios
5.3.4.10. Decomposição de valores singulares e determinantes
5.3.4.11. Formação de matrizes particionadas, cbind () e rbind ()
5.3.4.12. A função de concatenação, c (), com matrizes

5.3.5. Tabelas de frequência de fatores
5.3.6. Listas

5.3.6.1. Construção e modificação de listas
5.3.6.2. Listas de concatenação

5.3.7. DataFrames

5.3.7.1. Como criar dataframes?
5.3.7.2. Anexar () e separar ()
5.3.7.3. Trabalhar com dataframes

5.4. Leitura e escrita de dados

5.4.1. A função read.table ()
5.4.2. A função scan()
5.4.3. Acesso aos conjuntos de dados incorporados
5.4.4. Carregando dados de outros pacotes R
5.4.5. Edição de dados

5.5. Agrupamento, loops e execução condicional

5.5.1. Expressões agrupadas
5.5.2. Declarações de controlo

5.5.2.1. Execução condicional: sentenças IF
5.5.2.2. Execução repetitiva: para loops, repetição e tempo

5.6. Escrevendo as suas próprias funções

5.6.1. Exemplos simples
5.6.2. Definição de novos operadores binários
5.6.3. Argumentos com nome e valores padrão
5.6.4. O argumento "..."0
5.6.5. Atribuições dentro das funções

Módulo 6 Ambiente gráfico em R

6.1. Procedimentos gráficos

6.1.1. Comandos de traçado de alto nível

6.1.1.1. A função de plot ()
6.1.1.2. Visualização de dados multivariados
6.1.1.3. Gráficos de tela
6.1.1.4. Argumentos para funções de traçado de alto nível

6.1.2. Comandos de traçado de alto nível

6.1.2.1. Anotação matemática
6.1.2.2. Fontes vetoriais Hershey

6.1.3. Interagindo com os gráficos
6.1.4. Uso de parâmetros gráficos

6.1.4.1. Mudanças permanentes: a função par ()
6.1.4.2. Mudanças temporais: Argumentos às funções gráficas

6.1.5. Lista de parâmetros gráficos

6.1.5.1. Elementos gráficos
6.1.5.2. Eixos e marcações
6.1.5.3. Margens da figura
6.1.5.4. Ambiente com múltiplas imagens

6.1.6. Estatística descritiva: Representações gráficas

Módulo 7. Análise estatística em R

7.1. Distribuições discretas de probabilidade
7.2. Distribuições de probabilidade contínuas 
7.3. Introdução à Inferência e Amostragem (Estimativa de Pontos)
7.4. Intervalos de confiança
7.5. Contrastes de hipóteses
7.6. ANOVA de um fator
7.7. Testes de Ajustamento (teste do qui-quadrado)
7.8. Pacote fitdist
7.9. Introdução às estatísticas multivariadas

Módulo 8. Machine learning para a análise de big data

8.1. Introdução a Machine Learning
8.2. Apresentação de problemas, carregamento de dados e bibliotecas
8.3. Limpeza de dados (NAs, categorias, variáveis dummy)
8.4. Análise de dados exploratórios (ggplot) + Validação cruzada
8.5. Algoritmos de previsão: Regressão Linear Múltipla, Máquina de Suporte Vetorial, Árvores de Regressão, Random Forest…
8.6. Algoritmos de classificação: Regressão Logística, Máquina de Suporte Vetorial, Árvores de Regressão, Random Forest…
8.7. Ajuste dos hiperparâmetros do algoritmo
8.8. Predição de dados com os diferentes modelos
8.9. Curvas ROC e Matrizes de Confusão para avaliar a qualidade do modelo

Módulo 9. Mineração de dados aplicados à genómica

9.1. Introdução
9.2. Inicialização de variáveis
9.3. Limpeza e condicionamento do texto
9.4. Geração da Matriz de Termos

9.4.1. Criação da Matriz de Termos TDM
9.4.2. Visualizações sobre a matriz de palavras TDM

9.5. Descrição da matriz de termos

9.5.1. Representação gráfica das frequências
9.5.2. Construção de uma nuvem de palavras

9.6. Criação de um Data Frame apto para K-NN
9.7. Construção do Modelo de Classificação
9.8. Validação do Modelo de Classificação
9.9. Exercício prático guiado sobre mineração de dados em genómica do cancro

Módulo 10. Técnicas de mineração de dados genómicos

10.1. Introdução ao "scraping data"
10.2. Importação de arquivos de dados de folhas de cálculo armazenadas online
10.3. Scraping de texto HTML
10.4. Scraping de dados de uma tabela HTML
10.5. Aproveitando as APIs para scraping de dados
10.6. Extraindo informações relevantes
10.7. Usando o pacote Rvest em R
10.8. Obtenção de dados distribuídos em várias páginas
10.9. Extração de dados genómicos da plataforma "My Cancer Genome"
10.10. Extração de informações genéticas do banco de dados HGNC HUGO Gene Nomenclature Committee
10.11. Extração de dados farmacológicos do banco de dados ONCOKG (Precision Oncology Knowledge Base).

Módulo 11. Novas técnicas na era genómica

11.1. Entendendo a nova tecnologia: Next Generation Sequence (NGS) na prática clínica

11.1.1. Introdução
11.1.2. Antecedentes
11.1.3. Problemas na aplicação do sequenciamento Sanger em oncologia
11.1.4. Novas Técnicas de sequenciamento 
11.1.5. Vantagens do uso do NGS na prática clínica
11.1.6. Limitações do uso de NGS na prática clínica
11.1.7. Termos e definições relevantes
11.1.8. Tipos de estudos de acordo com o tamanho e profundidade

11.1.8.1. Genomas
11.1.8.2. Exomas
11.1.8.3. Painéis multigênicos

11.1.9. Etapas no sequenciamento NGS

11.1.9.1. Preparação de amostras e bibliotecas
11.1.9.2. Preparação de templates e sequenciamento
11.1.9.3. Processamento bioinformático

11.1.10. Anotação e classificação de variantes

11.1.10.1. Bases de dados demográficos
11.1.10.2. Bases de dados específicas do local
11.1.10.3. Preditores bioinformáticos de funcionalidade

11.2. Sequenciamento de ADN e análise bioinformática

11.2.1. Introdução
11.2.2. Software
11.2.3. Procedimento

11.2.3.1. Extração de sequências brutas
11.2.3.2. Alinhamento de sequências
11.2.3.3. Refinamento do alinhamento
11.2.3.4. Chamada de variantes
11.2.3.5. Filtragem de variantes

11.3. Sequenciamento de ARN e análise bioinformática

11.3.1. Introdução
11.3.2. Software
11.3.3. Procedimento

11.3.3.1. Avaliação de CQ de dados brutos
11.3.3.2. Filtragem ARNr
11.3.3.3. Dados filtrados de controlo de qualidade 
11.3.3.4. Corte de qualidade e remoção do adaptador
11.3.3.5. Alinhamento de reads a uma referência
11.3.3.6. Chamada de variantes
11.3.3.7. Análise da expressão génica diferencial

11.4. Tecnologia ChIP-Seq

11.4.1. Introdução
11.4.2. Software
11.4.3. Procedimento

11.4.3.1. Descrição do conjunto de dados da CHiP-Seq
11.4.3.2. Obter informações sobre o experimento utilizando os sites GEO e SRA
11.4.3.3. Controlo de qualidade dos dados de sequenciamento
11.4.3.4. Corte e filtragem de reads
11.4.3.5. Visualização de resultados com Integrated Genome Browser (IGV)

11.5. Big Data aplicado à oncologia genómica

11.5.1. O processo de análise de dados

11.6. Servidores genómicos e bancos de dados de variantes genéticas

11.6.1. Introdução
11.6.2. Servidores genómicos da web
11.6.3. Arquitetura de servidores genómicos
11.6.4. Recuperação e análise de dados
11.6.5. Personalização

11.7. Anotação de variantes genéticas

11.7.1. Introdução
11.7.2. O que é a chamada de variante?
11.7.3. Entender o formato do VCF
11.7.4. Identificadores de variantes
11.7.5. Análise de variantes
11.7.6. Prevendo o efeito da variação na estrutura e função da proteína

Módulo 12. Aplicações da bioinformática na oncologia genómica

12.1. Enriquecimento clínico e farmacológico de variantes de genes
12.2. Busca massiva de informações genómicas em PubMed
12.3. Busca massiva de informações genómicas em DGIdb
12.4. Busca em massa de ensaios clínicos sobre dados genómicos em Clinical Trials
12.5. Busca de similaridade genética para interpretação de um painel genético ou de um exoma
12.6. Busca massiva de genes relacionados a doenças
12.7. Enrich-Gen: Plataforma de enriquecimento clínico e farmacológico de genes
12.8. O procedimento do relatório genómico na era da oncologia de precisão

Módulo 13. Cancro da mama

13.1. Princípios do cancro da mama

13.1.1. Epidemiologia
13.1.2. Fatores de risco

13.2. Rastreio
13.3. Diagnóstico

13.3.1. Apresentação clínica e diagnóstico

13.4. Estadiamento
13.5. Subtipos
13.6. Tratamento doença luminal

13.6.1. Doença localizada
13.6.2. Doença avançada

13.7. Tratamento doença Her-2

13.7.1. Doença localizada
13.7.2. Doença avançada

13.8. Tratamento da doença triplo negativa

13.8.1. Doença localizada
13.8.2. Doença avançada

13.9. Perspetivas futuras para a doença luminal
13.10. Perspetivas futuras para a doença não luminal

Módulo 14. Cancro do pulmão

14.1. Princípios de cancro do pulmão

14.1.1. Epidemiologia
14.1.2. Fatores de risco

14.2. Principais mutações: possíveis alvos
14.3. Diagnóstico
14.4. Estadiamento
14.5. Tratamento da doença localizada do cancro microcítico
14.6. Tratamento da doença disseminada do cancro microcítico
14.7. Tratamento da doença localizada do cancro não microcítico
14.8. Tratamento da doença disseminada do cancro não microcítico

14.8.1. Adenocarcinoma
14.8.2. Carcinoma epidermoide

14.9. Perspetivas futuras
14.10. Prevenção primária

Módulo 15. Tumores ORL

15.1. Cancro ORL

15.1.1. Epidemiologia
15.1.2. Fatores de risco

15.2. Principais mutações: possíveis alvos
15.3. Diagnóstico
15.4. Estadiamento
15.5. Tratamento dos tumores localizados da laringe
15.6. Tratamento dos tumores da faringe
15.7. Tratamento de tumores ORL avançados
15.8. Tratamento dos tumores localizados do cavum 
15.9. Tratamento de tumores avançados do cavum
15.10. Perspetivas futuras

Módulo 16. Cancro colorretal e canal anal

16.1. Cólon e canal anal

16.1.1. Epidemiologia
16.1.2. Fatores de risco

16.2. Diagnóstico
16.3. Estadiamento
16.4. Tratamento da doença localizada do cancro do cólon
16.5. Tratamento da doença localizada cancro retal
16.6. Tratamento da doença avançada do cancro colorretal
16.7. Tratamento dos tumores do canal anal
16.8. Perspetivas futuras
16.9. Rastreio
16.10. Síndromes genéticas associados

Módulo 17. Tumores digestivos no colorretal

17.1. Tumores digestivos no colorretal

17.1.1. Epidemiologia
17.1.2. Fatores de risco

17.2. Diagnóstico
17.3. Estadiamento

17.3.1. Cancro do esófago
17.3.2. Cancro do estômago
17.3.3. Cancro do pâncreas

17.4. Cancro do esófago

17.4.1. Tratamento de doenças localizadas
17.4.2. Tratamento doença disseminada 

17.5. Cancro do estômago

17.5.1. Tratamento de doenças localizadas
17.5.2. Tratamento doença disseminada

17.6. Cancro do pâncreas

17.6.1. Tratamento de doenças localizadas
17.6.2. Tratamento doença disseminada

17.7. Cancro das vias biliares
17.8. Hepatocarcinoma
17.9. Tumores neuroendócrinos
17.10. Perspetivas futuras

Módulo 18. Tumores ginecológicos

18.1. Tumores ginecológicos

18.1.1. Epidemiologia
18.1.2. Fatores de risco

18.2. Diagnóstico
18.3. Estadiamento

18.3.1. Cancro dos ovários
18.3.2. Cancro do colo do útero
18.3.3. Cancro de endométrio

18.4. Tratamento do cancro do ovário localizado
18.5. Tratamento do cancro do ovário avançado
18.6. Tratamento do cancro do útero localizado

18.6.1. Cervix
18.6.2. Endométrio

18.7. Tratamento do cancro do útero avançado

18.7.1. Cervix
18.7.2. Endométrio

18.8. Sarcomas uterinos
18.9. Síndromes genéticas associadas
18.10. Perspetivas futuras

Módulo 19. Tumores urológicos

19.1. Desenvolvimentos

19.1.1. Epidemiologia

19.2. Diagnóstico

19.2.1. Cancro de próstata
19.2.2. Cancro urotelial
19.2.3. Cancro renal
19.2.4. Cancro testicular

19.3. Estadiamento

19.3.1. Cancro da próstata
19.3.2. Cancro urotelial
19.3.3. Cancro renal

19.4. Tratamento do cancro da próstata localizado
19.5. Tratamento do cancro da próstata avançado
19.6. Tratamento do cancro urotelial localizado
19.7. Tratamento do cancro urotelial avançado
19.8. Tratamento do cancro renal
19.9. Tratamento do cancro testicular
19.10. Cancro peniano

Módulo 20. Sarcomas e melanomas

20.1. Princípios dos tumores mesenquimatosos
20.2. Diagnóstico dos tumores mesenquimatosos
20.3. Tratamento cirúrgico dos tumores dos ossos e dos tecidos moles
20.4. Tratamento médico sarcomas

20.4.1. Ósseos
20.4.2. Tecidos moles

20.5. Tratamento de GIST
20.6. Melanoma
20.7. Diagnóstico e Estadiamento Melanoma
20.8. Tratamento de melanoma localizado
20.9. Tratamento de melanoma avançado
20.10. Perspetivas futuras

20.10.1. Tumores ósseos e dos tecidos moles
20.10.2. Melanoma

Módulo 21. Tumores cerebrais

21.1. Desenvolvimentos

21.1.1. Epidemiologia

21.2. Classificação
21.3. Síndromes genéticas associados
21.4. Fatores prognósticos e preditivos de resposta
21.5. Diagnóstico
21.6. Tratamento de tumores de baixo grau
21.7. Tratamento de tumores de alto grau
21.8. Imunoterapia
21.9. Metástases cerebrais
21.10. Perspetivas futuras

Módulo 22. Radioterapia

22.1. Desenvolvimentos
22.2. Tipos de radioterapia
22.3. Tratamento do cancro da mama
22.4. Tratamento do cancro do pulmão
22.5. Tratamento do cancro da próstata
22.6. Tratamento dos tumores digestivos
22.7. Tratamento dos tumores cerebrais
22.8. Tratamento dos tumores ORL
22.9. Tumores orbitais, tumores do mediastino, tumores mesenquimatosos
22.10. Radioterapia paliativa

Módulo 23. Caracterização e Áreas de Aplicação da Psico-Oncologia

23.1. O cancro e o seu impacto atual na sociedade

23.1.1. Variabilidade cultural
23.1.2. Incidência, prevalência e mortalidade

23.2. Mitos, crenças e pseudoterapias contra o cancro
23.3. Cuidados médicos para doentes oncológicos

23.3.1. Deteção precoce do cancro
23.3.2. Cirurgia e tratamento

23.4. Fatores de risco e Cancro

23.4.1. Psiconeuroimunologia
23.4.2. Stress, estilos de confronto e variáveis de personalidade

23.5. Prevenção do cancro

23.5.1. Prevenção primária e secundária
23.5.2. Educação para a saúde e estilos de vida saudáveis

23.6. O papel do psico-oncologista. O seu papel no contexto hospitalar
23.7. Ensino, formação, especialização e acreditação em psico-oncologia
23.8. Objetivos e áreas de intervenção psicológica para doentes com cancro e as suas famílias
23.9. Outras disciplinas relacionadas com a psico-oncologia

23.9.1. A psico-oncologia como interseção entre a oncologia e a psicologia

23.10. Abordagem das necessidades sociais dos doentes oncológicos

23.10.1. Impacto económico e laboral Reinserção laboral
23.10.2. Apoio social e o cancro

Módulo 24. Tratamentos Psicológicos em casos de Cancro e Terapias de Terceira Geração

24.1. Tratamentos psicológicos eficazes na psico-oncologia
24.2. Terapia cognitivo-comportamental no tratamento do cancro

24.2.1. Identificar os pensamentos automáticos e modificação das cognições
24.2.2. Técnicas de controlo da ativação

24.2.2.1. Treino de respiração diafragmática
24.2.2.2. Relaxamento muscular progressivo

24.2.3. Ativação comportamental
24.2.4. Técnicas de exposição e imaginação guiada

24.3. Programa de formação cognitiva
24.4. Programa de reabilitação baseado no exercício físico
24.5. Mindfulness ou consciência plena

24.5.1. Curso de qualificação em mindfulness
24.5.2. Prática da compaixão e da autocompaixão

24.6. Terapia de Aceitação e Compromisso (ACT)

24.6.1. Componentes da ACT e métodos clínicos

24.7. Terapia centrada na procura do sentido

24.7.1. Cancro e sentido Exploração das fontes de sentido

24.8. Terapia da dignidade

24.8.1. O conceito de dignidade no doente oncológico
24.8.2. Modelos de Dignidade Chochinov

24.9. Terapia familiar sistémica

24.9.1. Família e cancro Dinâmicas familiares mais frequentes

24.10. Pseudoterapias e pseudociências contra o cancro

24.10.1. Posições dos organismos oficiais
24.10.2. Pseudoterapias e pseudociências com e sem provas científicas

Módulo 25. Aspetos psicológicos mais relevantes de acordo com as diferentes localizações dos tumores

25.1. Leucemias, linfomas e mielomas

25.1.1. Transplante de medula óssea e situações de isolamento

25.2. Cancro da mama e ginecológico

25.2.1. Imagem corporal
25.2.2. Sexualidade
25.2.3. Autoestima
25.2.4. Efeito chemobrain

25.3. Cancro da próstata

25.3.1. Incontinência e impotência sexual

25.4. Cancro do cólon e do aparelho digestivo

25.4.1. Viver com uma colostomia

25.5. Intervenção em doentes laringectomizados

25.5.1. Intervenção da terapia da fala
25.5.2. Perturbação da vida sócio-ocupacional

25.6. Tumores na cabeça e no pescoço
25.7. Cancro da tiroide
25.8. Tumores do sistema nervoso central

25.8.1. Défices cognitivos e dificuldades de mobilidade

25.9. Cancro do pulmão
25.10. Cancro infantil

25.10.1. Desenvolvimento emocional e intelectual da criança
25.10.2. Impacto social na criança
25.10.3. Impacto na família

Módulo 26. Protocolos de Intervenção Emocional no Fim da Vida

26.1. Objetivos dos cuidados paliativos
26.2. Avaliação do sofrimento
26.3. O processo de adaptação psicossocial no fim da vida

26.3.1. Reações adaptativas vs. Desadaptativas

26.4. Modelo triádico de interação paciente-família-profissional de saúde
26.5. Intervenções específicas centradas no doente

26.5.1. Ansiedade
26.5.2. Tristeza
26.5.3. Hostilidade
26.5.4. Medo
26.5.5. Culpa
26.5.6. Negação
26.5.7. Retraimento

26.6. Necessidades específicas da família. Avaliação da unidade doente-família

26.6.1. Conspiração do silêncio
26.6.2. Claudicação familiar

26.7. Intervenções dirigidas aos profissionais de saúde

26.7.1. Trabalho em equipa multidisciplinar
26.7.2. Prevenção da Síndrome de Burnout

26.8. Assistência às necessidades espirituais do doente

26.8.1. Modelo de Assistência Espiritual da SECPAL
26.8.2. Angústia existencial e experiência religiosa

26.9. Intervenção psicológica nos cuidados paliativos pediátricos
26.10. Processo e planificação antecipada de tomada de decisões (PAD)

26.10.1. Declaração e registo das Diretivas Antecipadas de Vontade (DAV) 

Módulo 27. Avaliação e instrumentos de medição

27.1. A entrevista clínica em Psico-oncologia
27.2. Avaliação das necessidades dos doentes oncológicos

27.2.1. Questionário de avaliação das necessidades (Needs Evaluation Questionnaire, NEQ)
27.2.2. Ferramenta de avaliação das necessidades (Patient Needs Assessment Tool, PNTA)
27.2.3. Questionário breve sobre as necessidades relacionadas com o cancro (The short-form Cancer Needs Questionnaire, CNQ)

27.3. Avaliação da qualidade de vida em doentes oncológicos

27.3.1. Questionário da EORTC (European Organization for Research and Therapy of Cancer)
27.3.2. Questionário FACT (Functional Assessment of Cancer Therapy)
27.3.3. Questionário de saúde SF, 36

27.4. Principais questionários para a avaliação dos sintomas físicos no cancro

27.4.1. Versão espanhola do Edmonton Symptom Assessment Sytem (ESAS)
27.4.2. Questionários para a avaliação da dor
27.4.3. Questionários para a avaliação da fadiga e da qualidade do sono
27.4.4. Questionários de screening cognitivo e estado funcional
27.4.5. Questionário para a avaliação da sexualidade

27.5. Deteção do mal-estar e avaliação do sofrimento

27.5.1. Questionário de Deteção do Mal Estar Emocional (DME)
27.5.2. Termómetro de distresse emocional
27.5.3. Escala de Ansiedade e Depressão Hospitalar (HAD)
27.5.4. A perceção subjetiva da passagem do tempo
27.5.4.1. Os tempos de espera em oncologia

27.6. Avaliação sociofamiliar

27.6.1. Perceção da função familiar Questionário APGAR familiar
27.6.2. Índice de Relações Familiares (Family Relationship Index, FRI)
27.6.3. Autorrelato do Inventário Familiar (Self report Family Inventory, SFI)

27.7. Questionários de avaliação do confronto para doentes oncológicos

27.7.1. Escala de Ajustamento Mental ao Cancro (Mental Adjustment to Cancer, MAC)
27.7.2. Questionário para medir os estilos de confronto Escala de Estilo Comportamental de Miller (Miller Behavioral Style Scale, MBSS)
27.7.3. Questionário COPE

27.8. Ferramenta de avaliação das necessidades espirituais

27.8.1. Escala de avaliação das necessidades e do bem-estar espiritual do GES SECPAL
27.8.2. Questionário do Sentido da Vida e FACIT-Sp (Functional Assessment of Chronic Illness Therapy Spiritual Well Being)
27.8.3. Escala de Dignidade do Doente (The Patient Dignity Inventory)

27.9. Auto-registo e observação

27.9.1. Formulação de casos clínicos

27.10. A avaliação psicológica da criança nos cuidados paliativos

Módulo 28. A comunicação com o paciente oncológico

28.1. Doença, comunicação e relação de ajuda

28.1.1. A comunicação médico-paciente como possível fator de melhoria ou iatrogenia. Prevenção da dor e do sofrimento
28.1.2. Barreiras de comunicação

28.2. Como dar más notícias sobre o cancro

28.2.1. Respostas a perguntas difíceis
28.2.2. Comunicação em situações complicadas

28.3. Técnicas de Counselling na atividade clínica

28.3.1. Ações de Counselling
28.3.2. Comunicação assertiva
28.3.3. Controlo emocional
28.3.4. Solução de problemas e tomada de decisões responsáveis

28.4. Modelos de relação e influência terapêutica

28.4.1. Modelo paternalista
28.4.2. Modelo informativo
28.4.3. Modelo interpretativo
28.4.4. Modelo deliberativo

28.5. Ferramentas de apoio emocional para o cancro

28.5.1. Como falar com um doente oncológico. Guia para familiares e amigos
28.5.2. Níveis de interação emocional

28.6. Comunicação não verbal na relação de ajuda
28.7. Comunicação nos cuidados paliativos e no final da vida

28.7.1. Aprender a falar da morte

28.8. Falar sobre o cancro com crianças
28.9. Comunicação em pessoas com défices de comunicação
28.10. Tratamento do cancro nos meios de comunicação

28.10.1. O cancro nas redes sociais

Módulo 29. Gestão do luto

29.1. Morte, cultura e sociedade

29.1.1. Profissionais de saúde perante a morte

29.2. Avaliação psicológica do luto

29.2.1. Entrevista e instrumentos de avaliação específicos

29.3. Reações frequentes do luto

29.3.1. Luto normal e luto complicado
29.3.2. Fatores de vulnerabilidade
29.3.3. Diagnóstico diferencial entre luto e depressão

29.4. Principais modelos teóricos do luto

29.4.1. Teoria da Vinculação de Bowlby
29.4.2. Crenças nucleares e reconstrução de significados
29.4.3. Modelos concetuais de trauma

29.5. Objetivos da intervenção no luto e intervenções recomendadas

29.5.1. Facilitando o processo normal do luto. Prevenção do luto complicado
29.5.2. Sugestões de intervenção antes e depois da morte
29.5.3. Psicoterapia do luto a partir de um modelo relacional integrador

29.6. Intervenção em grupo na assistência ao luto

29.6.1. Intervenção psicológica no luto pela perda de um filho

29.7. As etapas do luto

29.7.1. Tarefas do luto

29.8. O luto nas crianças
29.9. Suicídio e cancro
29.10. Psicofarmacologia no tratamento do luto

Módulo 30. Outras intervenções psicológicas em áreas específicas relacionadas com o cancro

30.1. Tratamento psicológico para deixar de fumar:

30.1.1. Mitos sobre o tabaco
30.1.2. Análise do comportamento tabágico. Dependência física e psicológica
30.1.3. Estrutura do programa. Sessões e metodologia
30.1.4. Abstinência e prevenção de recaídas

30.2. Deteção precoce do cancro

30.2.1. Exames de screening (mamografia, TSOH, citologia, etc.)
30.2.2. Ansiedade antecipatória e dificuldades de participação
30.2.3. Aconselhamento genético oncológico

30.3. Grupos de ajuda mútua ou de autoajuda
30.4. Grupos psico-educativos para familiares e doentes

30.4.1. Questões a abordar e metodologia de trabalho
30.4.2. Critérios de inclusão e exclusão

30.5. Intervenção psicológica em sobreviventes de cancro. Regresso à normalidade
30.6. Controlo dos efeitos secundários em doentes com cancro

30.6.1. Controlo da dor
30.6.2. Contra a fadiga e o sono
30.6.3. Controlo da sexualidade
30.6.4. Distúrbios cognitivos. Efeito chemobrain

30.7. Preparação e intervenção para hospitalização e cirurgia
30.8. Preparação psicológica para outros tratamentos médicos (quimioterapia, radioterapia, etc.)
30.9. Intervenção psicológica no transplante de medula óssea (TMO)
30.10. Estratégias para qualificar voluntários para cuidar de doentes com cancro

30.10.1. A entrevista de voluntariado. Corresponder e fazer corresponder o voluntário a cada perfil
30.10.2. Formação específica para voluntários. Mentoria e monotorização

Módulo 31. Investigação do Cancro

31.1. Declaração mundial pela investigação do cancro
31.2. Metodologia de investigação no cancro

31.2.1. Área de prevenção do cancro
31.2.2. Área de tratamento do cancro

31.3. Erros frequentes da investigação em psico-oncologia
31.4. Passos a seguir para realizar uma investigação em psico-oncologia
31.5. Investigação epidemiológica do cancro
31.6. Investigação biomédica

31.6.1. Participação em ensaios clínicos sobre o cancro
31.6.2. Dúvidas, riscos e benefícios
31.6.3. Distribuição dos ensaios clínicos por tipo de cancro

31.7. Principais progressos na investigação

31.7.1. Áreas prioritárias da investigação em psico-oncologia
31.7.2. Áreas prioritárias da investigação nos cuidados paliativos
31.7.3. Novas linhas de investigação

31.8. Linhas de investigação do trabalho social
31.9. Publicações sobre psico-oncologia e cuidados paliativos em revistas científicas

31.9.1. Redação de artigos científicos

Módulo 32. Aspetos éticos da psico-oncologia e da psicologia nos cuidados paliativos

32.1. Dizer ou não a verdade aos doentes. Gestão da verdade suportável
32.2. Cancro e ética, uma interação completa

32.2.1. Bioética principialista
32.2.2. Bioética personalista
32.2.3. Princípio do duplo efeito

32.3. Fundamentos antropológicos

32.3.1. Experiência de fragilidade
32.3.2. Experiência de sofrimento
32.3.3. A pessoa como curador ferido

32.4. Direitos do doente com cancro

32.4.1. Lei da autonomia do paciente
32.4.2. Consentimento informado
32.4.3. LOPD e confidencialidade dos registos médicos

32.5. Deveres éticos dos profissionais de saúde que cuidam de doentes com cancro
32.6. Morte digna

32.6.1. Suicídio assistido e eutanásia
32.6.2. Adequação ou limitação do tratamento, recusa de tratamento, sedação, obstinação terapêutica

32.7. Participação do doente no seu processo de doença, tratamento e tomada de decisões

32.7.1. O diálogo moral

32.8. Humanização no cuidado do doente oncológico

32.8.1. Qualidade e conforto

32.9. Comités de ética dos cuidados de saúde e de investigação clínica
32.10. Desigualdades e equidade no combate ao cancro

32.10.1. Situação atual dos cuidados paliativos

O conteúdo do Advanced master oferece uma seleção de leituras complementares, incluindo artigos científicos, revisões e orientações clínicas, que complementam e expandem o conteúdo teórico do mesmo"