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Module 1. Principes fondamentaux de l'écologie 

1.1. Écologie générales I  

1.1.1. Stratégies de reproduction 
1.1.2. Indicateurs biologiques 

 1.1.2.1. Productivité 
 1.1.2.2. Rapport de masculinité 
 1.1.2.3. Taux de vol 
 1.1.2.4. Taux de natalité opérationnel 
 1.1.2.5. Succès reproductif 

1.2. Écologie générales II 

1.2.1. Taux de natalité et mortalité 
1.2.2. Croissance
1.2.3. Densité et valorisation 

1.3. Écologie des populations

1.3.1. Le grégarisme et le territorialisme 
1.3.2. Domaine d'intervention 
1.3.3. Schéma d'activité 
1.3.4. Structure par âge 
1.3.5. Prédation 
1.3.6. Alimentation animale 
1.3.7. Extinction: périodes critiques 

1.4. Conservation de la biodiversité  

1.4.1. Périodes critiques du cycle de vie 
1.4.2. Catégories de l'UICN 
1.4.3. Indicateurs de conservation 
1.4.4. Vulnérabilité à l'extinction  

1.5. Espèces de substitution (surrogate species) I 

1.5.1. Espèces clés (keystone species) 

 1.5.1.1. Description 
 1.5.1.2. Exemples concrets 

1.5.2. Espèces parapluies (umbrella species) 

 1.5.2.1. Description 
 1.5.2.2. Exemples concrets 

1.6. Espèces de substitution (surrogate species) II

1.6.1. Espèces phares (flagship species) 

 1.6.1.1. Description 
 1.6.1.2. Exemples concrets 

1.6.2. Espèces indicatrices 

 1.6.2.1. Sur l'état de la biodiversité 
 1.6.2.2. Sur l'état de l'habitat 
 1.6.2.3. Sur l'état des populations 

1.7. Écologie végétale

1.7.1. Successions végétales 
1.7.2. Interaction animal-végétal 
1.7.3. Biogéographie 

1.8. Écosystèmes  

1.8.1. Structure 
1.8.2. Facteurs 

1.9. Systèmes et communautés biologiques  

1.9.1. Communauté 
1.9.2. Structure 
1.9.3. Biomes

1.10. Flux d'énergie  

1.10.1. Cycles des nutriments 

Module 2. Bases réglementaires de la conservation des espèces 

2.1. Convention sur la diversité biologique  

2.1.1. Mission et objectifs  
2.1.2. Plan stratégique en matière de biodiversité 

2.2. Convention sur le commerce international des espèces de faune et de flore sauvages menacées d'extinction 

2.2.1. Structure et objectifs 
2.2.2. Annexes I, II et III

2.3. Convention de Ramsar

2.3.1. Structure et objectifs 
2.3.2. Désignation de sites Ramsar 

2.4. Autres conventions internationales  

2.4.1. Convention des Nations unies sur la lutte contre la désertification 
2.4.2. Convention de Bonn sur la conservation des espèces migratrices 
2.4.3. Convention OSPAR 

2.5. Convention de Berne

2.5.1. Structure et objectifs 

2.6. Amérique du Sud. Stratégies nationales pour la biodiversité  

2.6.1. Convention sur la diversité biologique 
2.6.2. Principaux axes d'action 

Module 3. Gestion de la Faune Sauvage 

3.1. Gestion des zones naturelles protégées  

3.1.1. Introduction 
3.1.2. Structure 
3.1.3. Restrictions 

3.2. Gestion pour la conservation des espèces menacées  

3.2.1. Plans d’action 
3.2.2. Plans de relance 

3.3. Gestion du réseau Natura 2000 

3.3.1. Structure 
3.3.2. Indicateurs 
3.3.3. Actions 

3.4. Gestion forestière  

3.4.1. Planification forestière  
3.4.2. Projets de gestion 
3.4.3. Principales interactions entre la gestion forestière et la conservation des espèces 

3.5. Gestion sur site 

3.5.1. Actions en faveur de l'habitat 
3.5.2. Actions sur les proies et les prédateurs 
3.5.3. Actions sur l'alimentation 

3.6. Gestion ex-situ  

3.6.1. Élevage en captivité 
3.6.2. Réintroductions 
3.6.3. Translocations 
3.6.4. Centres de récupération 

3.7. Gestion des Espèces Exotiques Envahissantes (EEE) 

3.7.1. Stratégies et plans 

3.8. Outils de gestion: accès à l'information  

3.8.1. Sources des données 

3.9. Instruments de gestion: stratégies  

3.9.1. Lignes principales 
3.9.2. Stratégies contre les principales menaces 

Module 4. Recensements de la faune 

4.1. Introduction aux méthodes d'observation  

4.1.1. Observation directe 
4.1.2. Signes 

 4.1.2.1. Directs 
 4.1.2.2. Indirects 

4.1.3. Pêche électrique 

4.2. Signes indirects. Naturels I 

4.2.1. Naturels 

 4.2.1.1. Empreintes 
 4.2.1.2. Chemins et marches 
 4.2.1.3. Excréments et boulettes 

4.3. Signes indirects. Naturel II  

4.3.1. Lieux de couchage, lits et terriers 
4.3.2. Marques territoriales 
4.3.3. Mues, cheveux, plumes et autres débris 

4.4. Signes indirects. Par des techniques  

4.4.1. Avec des dispositifs 

 4.4.1.1. Pièges à cheveux 
 4.4.1.2. Pièges à sable 
 4.4.1.3. Photo-trapping 

4.5. Conception du recensement 

4.5.1. Concepts préliminaires 

 4.5.1.1. Tailles et densité 
 4.5.1.2. Indice d'abondance  
 4.5.1.3. Exactitude et précision 

4.5.2. Populations 

 4.5.2.1. Avec une distribution globale 
 4.5.2.2. Répartis uniformément 
 4.5.2.1. Manipulation 

4.5.3. Détectabilité et capturabilité 
4.5.4. Collecte de données GPS   

4.6. Recensements directs. Statistique  

4.6.1. Piles 
4.6.2. Depuis les points d'observation 
4.6.3. Estimations à partir de la chasse 

4.7. Recensements directs. Dynamisme  

4.7.1. Recensement sur une parcelle sans battement 
4.7.2. Transects à bande fixe 
4.7.3. Transects linéaires 

 4.7.3.1. Capture-recapture 

  4.7.3.1.1. Avec modification du nombre d'individus 
  4.7.3.1.2. Aucun changement dans le nombre d'individus 

4.8. Surveillance de la faune  

4.8.1. Introduction à l'éthologie 
4.8.2. Conception de la recherche  

 4.8.2.1. Description du comportement 
 4.8.2.2. Choix des catégories 
 4.8.2.3. Mesures comportementales 
 4.8.2.4. Types d'échantillonnage  
 4.8.2.5. Types d'enregistrement 
 4.8.2.6. Stadia 

4.9. Empreintes  

4.9.1. Facteurs d'influence 
4.9.2. Informations écologiques 
4.9.3. Morphologie 
4.9.4. Trouver et préserver les empreintes 
4.9.5. Clés 

4.10. Programmes de surveillance de la faune sauvage

Module 5. Ressources pour l'acquisition et l'analyse de données sur la répartition des espèces, les espaces naturels et les variables environnementales régissant leurs habitats

5.1. Union internationale pour la conservation de la nature (UICN) 

5.1.1. Données sur les espèces et leur répartition
5.1.2. Outils disponibles pour l'analyse des données de distribution des espèces

5.2. Fonds mondial d'information sur la biodiversité (GBIF) 

5.2.1. Données sur les espèces et leur répartition
5.2.2. Outils disponibles pour l'analyse des données de distribution des espèces

5.3. e-BIRD 

5.3.1. La science citoyenne dans la gestion du big data mondial lié aux espèces
5.3.2. Données et répartition de l'avifaune issues de la science citoyenne

5.4. MammalNet 

5.4.1. Données et suivi des mammifères grâce à la science citoyenne

5.5. Système d'information sur la biodiversité des océans (OBIS) 

5.5.1. Données sur la distribution des espèces marines 

5.6. Espèces et habitats intégrés dans le réseau Natura 2000 

5.6.1. Cartographie de la répartition des sites Natura 2000
5.6.2. Bases de données documentaires sur les espèces, les habitats et leurs informations écologiques officielles
5.6.3. Suivi de la distribution, des pressions, des menaces et de l'état de conservation par le biais de rapports officiels semestriels

5.7. Réseau mondial d'aires naturelles protégées 

5.7.1. Protected Planet dans la gestion des espèces territoriales

5.8. Milieux naturels et utilisation des sols 

5.8.1. Utilisation des sols Corine Land Cover (CLC) 
5.8.2. Global Land Cover (GLC) de l'Agence spatiale européenne pour l'identification des milieux naturels
5.8.3. Ressources foncières liées aux milieux forestiers
5.8.4. Ressources foncières liées aux zones humides

5.9. Variables environnementales bio-climatiques pour la modélisation de l'habitat des espèces 

5.9.1. Climat mondial
5.9.2. Bio-Oracle
5.9.3. Terra Climate
5.9.4. ERA5 Land
5.9.5. Global Weather

5.10. Variables environnementales morphologiques pour la modélisation de l'habitat des espèces 

5.10.1. Modèles numériques d'élévation
5.10.2. Modèles numériques de terrain

Module 6. Gestion territoriale des espèces à l'aide de systèmes d'information géographique dans QGIS 

6.1. Introduction aux systèmes d'information géographique (SIG) 

6.1.1. Introduction aux systèmes d'information géographique
6.1.2. Formats de fichiers cartographiques pour l'analyse des espèces
6.1.3. Principales analyses de géotraitement pour la gestion des espèces

6.2. Systèmes de référence dans les archives cartographiques

6.2.1. L'importance des systèmes de référence dans la visualisation et la précision des données de terrain liées à la distribution des espèces 
6.2.2. Exemples de gestion correcte et incorrecte des données dans le domaine des espèces

6.3. Interface QGIS 

6.3.1. Introduction à QGIS
6.3.2. Interface et sections à analyser et représentation des données

6.4. Visualisation et représentation des données dans QGIS 

6.4.1. Visualisation de données cartographiques dans QGIS
6.4.2. Tables d'attributs pour consulter et documenter les informations
6.4.3. Symbologie pour la représentation des données

6.5. Plugins QGIS pour la cartographie et l'analyse des espèces 

6.5.1. Plugins dans l'environnement QGIS
6.5.2. Plugin GBIF
6.5.3. Plugin Natusfera
6.5.4. Plugin Species Explorer
6.5.5. Plateformes de science citoyenne et autres plugins d'analyse

6.6. Gestion cartographique des parcelles d'échantillonnage et suivi sur le terrain 

6.6.1. Planification géométrique des parcelles et des grilles d'échantillonnage
6.6.2. Représentation des données de distribution, d'échantillonnage et de transects sur le terrain

6.7. Cartes de richesse et d'effort des espèces 

6.7.1. Analyse des données sur la richesse des espèces
6.7.2. Représentation des cartes de richesse
6.7.3. Analyse des données sur l'effort
6.7.4. Représentation des cartes de contraintes

6.8. Exemple pratique: analyse multicritères pour la cartographie de l'adéquation des espèces 

6.8.1. Introduction aux applications de cartographie de l'adéquation des terres
6.8.2. Analyse des variables environnementales liées à l'espèce
6.8.3. Analyse des valeurs de fitness pour les variables
6.8.4. Production de cartes d'adéquation des terres aux espèces

6.9. Création de corridors écologiques pour la distribution des espèces 

6.9.1. Introduction aux stratégies de connectivité spatiale pour la création de corridors écologiques
6.9.2. Cartes de résistance et de friction Vs cartes de convenance
6.9.3. Identification des points de connectivité
6.9.4. Développement de corridors écologiques pour la distribution des espèces

6.10. Considérations relatives à la collecte de données sur le terrain 

6.10.1. Technologies disponibles
6.10.2. Configuration du dispositif avant la collecte des données
6.10.3. Considérations techniques sur la documentation de l'information
6.10.4. Considérations en fonction de l'ampleur des travaux

Module 7. Modèles de distribution potentielle des espèces avec Maxent 

7.1. Maxent et modèles prédictifs 

7.1.1. Introduction à Maxent
7.1.2. Formats des fichiers d'analyse de la répartition des espèces

7.2. L'analyse cartographique dans les prévisions 

7.2.1. Coordonnées de distribution des espèces
7.2.2. Variables environnementales pour l'analyse des espèces

7.3. Ressources cartographiques pour la modélisation des espèces 

7.3.1. Données de base pour la modélisation
7.3.2. Ressources pour l'obtention de variables environnementales territoriales
7.3.3. Ressources pour obtenir des données sur la distribution des espèces
7.3.4. Stratégies d'adaptation des données aux formats requis par Maxent

7.4. Contraintes de format et limites des données d'entrée pour la modélisation des espèces 

7.4.1. Standardisation des formats pour les coordonnées de distribution des espèces
7.4.2. Standardisation des formats matriciels pour les variables spatiales dépendant des espèces

7.5. L'interface de gestion de Maxent pour la modélisation de la distribution des espèces 

7.5.1. Sections de saisie des données et de configuration du programme
7.5.2. Principales erreurs à éviter lors de la modélisation

7.6. Options de modélisation 

7.6.1. Modèle logistique
7.6.2. Modèle cumulatif
7.6.3. Modèle brut
7.6.4. Modélisation dans le cadre de scénarios futurs

7.7. Modélisation potentielle avec des variables et des données de distribution 

7.7.1. Coordonnées de distribution des espèces
7.7.2. Variables matricielles dépendant de l'espèce
7.7.3. Génération du modèle de distribution potentielle de l'espèce

7.8. Simulation et représentation des données Maxent 

7.8.1. Omission/commission
7.8.2. Contribution des variables
7.8.3. Courbes de réponse
7.8.4. Cartes de distribution résultantes
7.8.5. Données analytiques supplémentaires
7.8.6. Validation et test des données

7.9. Prévisions futures dans le cadre de scénarios de changement des terres

7.9.1. Variables environnementales futures
7.9.2. Modélisation de scénarios futurs 

7.10. Représentation et interprétation des modèles dans QGIS 

7.10.1. Importation des résultats dans QGIS
7.10.2. Symbologie et visualisation des résultats dans QGIS

Module 8. Gestion du jeu 

8.1. Introduction à la gestion du jeu  

8.1.1. Gestion du gibier et conservation des espèces  
8.1.2. Échelles de conservation 

 8.1.2.1. Durabilité 
 8.1.2.2. Conservation des habitats 
 8.1.2.3. Conservation des espèces 
 8.1.2.4. Conservation de la variabilité génétique 

8.2. Systèmes de régulation des pâturages  

8.2.1. Limites de l'environnement 
8.2.2. Méthodes de contrôle du pâturage  

 8.2.2.1. Rotation  
 8.2.2.2. Continum  

8.3. Estimation de la charge  

8.3.1. Méthodes de calcul

 8.3.1.1. Calcul de la capacité de charge simplifiée 
 8.3.1.2. Calcul de la capacité de charge mensuelle 
 8.3.1.3. Calcul des besoins des herbivores 
 8.3.1.4. Méthode "andalouse"  

8.3.2. Indicateurs  

8.4. Gestion du grand gibier  

8.4.1. Foresterie 

 8.4.1.1. Objectifs 
 8.4.1.2. Interactions  
 8.4.1.3. Compatibilités  
 8.4.1.4. Actions pour sa gestion 

8.4.2. Agriculture 

 8.4.2.1. Objectifs 
 8.4.2.2. Interactions  
 8.4.2.3. Compatibilités  
 8.4.2.4. Actions pour sa gestion 

8.5. Gestion du petit gibier  

8.5.1. Foresterie 

 8.5.1.1. Objectifs 
 8.5.1.2. Interactions  
 8.5.1.3. Compatibilités 
 8.5.1.4. Actions pour sa gestion 

8.5.2. Agriculture 

 8.5.2.1. Objectifs 
 8.5.2.2. Interactions  
 8.5.2.3. Compatibilités  
 8.5.2.4. Actions pour sa gestion 

8.6. Modalités de chasse  

8.6.1. Chasse au gros gibier 

8.6.1.1. Monteria 
8.6.1.2. Crochets et crochets 
8.6.1.3. Traque  
8.6.1.4. Attente 
8.6.1.5. Autre 

8.6.2. Petit gibier 

8.6.2.1. Sauter avec un chien 
8.6.2.2. Dans le scoutisme 
8.6.2.3. En mouvement et avec un poste fixe 
8.6.2.4. En main 
8.6.2.5. Perdrix avec un appel 
8.6.2.6. Autre 

8.7. Planification de la chasse  

8.7.1. Plans de chasse techniques 

8.7.1.1. Considérations initiales 
8.7.1.2. Restrictions 

8.7.2. Mesures de gestion de l'habitat 

8.7.2.1. Foresterie 
8.7.2.2. Agriculture 
8.7.2.3. Bétail 

8.8. Détermination des quotas   

8.8.1. Formules pour le petit gibier 

8.8.1.1. Estimations 
8.8.1.2. Exemple 

8.8.2. Formules pour le gros gibier 

8.8.2.1. Estimations 
8.8.2.2. Exemple 

8.8.3. Chasse sélective et chasse de gestion 

8.8.3.1. Critères 

8.9. Principales espèces de gibier   

8.9.1. Lapins 

8.9.1.1. Biologie de base 
8.9.1.2. Exigences écologiques 
8.9.1.3. Modalités de chasse 

8.9.2. Cerf 

8.9.2.1. Biologie de base 
8.9.2.2. Exigences écologiques 
8.9.2.3. Modalités de chasse 

8.9.3. Corzo 

8.9.3.1. Biologie de base 
8.9.3.2. Exigences écologiques 
8.9.3.3. Modalités de chasse 

8.9.4. Perdrix 

8.9.4.1. Biologie de base 
8.9.4.2. Exigences écologiques 
8.9.4.3. Modalités de chasse 

Module 9. Maladies de la Faune Sauvage 

9.1. Cadre réglementaire  

9.1.1. Normes Internationales 
9.1.2. Règlements de l'UE 

9.2. Lutte contre les maladies de la faune sauvage   

9.2.1. Conteneurs 
9.2.2. Limitation des contacts 
9.2.3. Réduire la prévalence 

 9.2.3.1. Éradication par l'élimination des hôtes sauvages 
 9.2.3.2. Réduction de la densité des hôtes sauvages 
 9.2.3.3. Réduction d'autres facteurs de risque 
 9.2.3.4. Traitements et vaccinations 

9.3. Indications de la maladie sauvage  

9.3.1. Maladie suspectée 

 9.3.1.1. Protocole d'action 

9.3.2. Confirmation de la maladie 

 9.3.2.1. Protocole d'action 

9.3.3. Gestion des sous-produits animaux dans les maladies de la faune sauvage 
9.3.4. Collecte de l'échantillon 

 9.3.4.1. Oiseaux 
 9.3.4.2. Mammifères 

9.4. Plan de surveillance des maladies de la faune sauvage  

9.4.1. Surveillance de la santé 

 9.4.1.1. Champ d'application géographique 
 9.4.1.2. Espèces cibles 
 9.4.1.3. Maladies ciblées 
 9.4.1.4. Surveillance active 
 9.4.1.5. Surveillance passive 

9.4.2. Zoonoses 

 9.4.2.1. Virales 
 9.4.2.2. Bactériennes 
 9.4.2.3. Parasites 

9.5. Capture, retrait et désinfection de la faune sauvage affectée  

9.5.1. Capture 

 9.5.1.1. Méthodes 

9.5.2. Élimination 

 9.5.2.1. Méthodes 

9.5.3. Nettoyage et lutte contre les vecteurs 

 9.5.3.1. Agents pathogènes 
 9.5.3.2. Principaux désinfectants chimiques 
 9.5.3.3. Mesures de sécurité du personnel 

9.6. Les maladies de la faune sauvage. Ruminants 

9.6.1. Pasteurellose 
9.6.2. Kératoconjonctivite 
9.6.3. Gale 
9.6.4. Tuberculose 
9.6.5. Fièvre aphteuse 
9.6.6. Tiques et autres maladies transmises par les tiques 
9.6.7. Boiterie 

9.7. Les maladies de la faune sauvage. Sanglier  

9.7.1. Peste porcine classique 
9.7.2. Peste porcine africaine 
9.7.3. La maladie d'Aujeszky 
9.7.4. Tuberculose 
9.7.5. Fièvre aphteuse 
9.7.6. Tiques et autres maladies transmises par les tiques 
9.7.7. Boiterie 

9.8. Les maladies de la faune sauvage. Carnivores  

9.8.1. Distemper 
9.8.2. Gale 
9.8.3. La maladie d'Aujeszky 
9.8.4. Tuberculose 
9.8.5. Tiques et autres maladies transmises par les tiques 

9.9. Les maladies de la faune sauvage. Oiseaux  

9.9.1. La grippe aviaire 
9.9.2. Maladie de Newcastle 
9.9.3. Botulisme 
9.9.4. Fièvre du Nil et autres flavivirus 

9.10. Les maladies de la faune sauvage. Lagomorphes  

9.10.1. Maladie hémorragique du lapin 
9.10.2. Gale 
9.10.3. Myxomatose 
9.10.4. Tularemia et yersiniosis 
9.10.5. Tiques et autres maladies transmises par les tiques 

Module 10. Logiciel de gestion de la faune sauvage: Statistiques et Distance 

10.1. Statistica: statistiques descriptives 

10.1.1. Introduction 
10.1.2. Statistiques 

 10.1.2.1. Taille de l'échantillon 
 10.1.2.2. Médias 
 10.1.2.3. Mode 
 10.1.2.4. Écart-type 
 10.1.2.5. Coefficient de variation 
 10.1.2.6. Variance 

10.1.3. Application en Statistica 

10.2. Statistica: probabilité et signification statistique 

10.2.1. Probabilités 
10.2.2. Signification statistique 
10.2.3. Distributions 

 10.2.3.1. Transformations 

10.3. Statistiques: régressions
10.4. Statistiques: définition des variables. Distributions sur les variables discrètes
10.5. Statistiques: définition des variables. Distributions sur les variables continues
10.6. Statistica: tests statistiques. Partie I
10.7. Statistica: tests statistiques. Partie II 
10.8. Distance: introduction  

10.8.1. Types de transects 

 10.8.1.1. Linéaire (Line Transect) 
 10.8.1.2. Points (Point Transect) 

10.8.2. Calcul des distances  

 10.8.2.1. Radial 
 10.8.2.2. Radial  

10.8.3. Objets 

 10.8.3.1. Individuels 
 10.8.3.2. Groupes (Clusters) 

10.8.4. Fonction de détection 

 10.8.4.1. Critères de sélection 
 10.8.4.2. Fonctions clés 

  10.8.4.2.1. Uniforme 
  10.8.4.2.2. Seminormal 
  10.8.4.2.3. Exponentielle négative 
  10.8.4.2.4. Taux de risque 

10.9. Distance. Approximation  

10.9.1. AIC 

 10.9.1.1. Limites 

10.9.2. Analyse des données 
10.9.3. Stratification 

10.10. Distance. Exemple  

10.10.1. Saisie de données 
10.10.2. Mise en place de l'analyse 
10.10.3. Troncature 
10.10.4. Agrégation des données 
10.10.5. Stratification 
10.10.6. Validation des résultats 

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