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Module 1. Infections mycobactériennes

1.1. Évolution
1.2. Problèmatique actuelle
1.3. Caractéristiques du genre Mycobacterium

1.3.1. Composition
1.3.2. Croissance et pigmentation
1.3.3. Caractère pathogène

1.4. Classification des Mycobactéries
1.5. Épidémiologie

1.5.1. Réservoirs
1.5.2. Mécanismes de transmission

1.6. Mécanismes pathogènes
1.7. Formes cliniques

1.7.1. Mycobacterium Tuberculosis Complex
1.7.2. Mycobactéries non tuberculeuses

1.8. Mesures de prévention et contrôle

1.8.1. Chimioprophylaxie
1.8.2. Vaccins

1.9. Biosécurité et mycobactéries

Module 2. Diagnostic de l'infection à mycobactéries

2.1. Suspicion clinique

2.1.1. Collecte de l'échantillon

2.2. Test tuberculinique

2.2.1. Effet booster
2.2.2. Inconvénients

2.3. Diagnostic par les IGRA

2.3.1. Systèmes commerciaux
2.3.2. Les avantages et inconvénients

2.4. Microscopie

2.4.1. Coloration conventionnelle
2.4.2. Coloration par microscopie à fluorescence

2.5. Culture

2.5.1. Phase de prétraitement
2.5.2. Culture en milieu solide
2.5.3. Culture en milieu liquide
2.5.4. Culture en systèmes automatisés

2.6. Techniques d'identification phénotypique

2.6.1. Microscopie et morphologie
2.6.2. Tests biochimiques

2.7. Techniques d'identification moléculaire

2.7.1. Types
2.7.2. Sur l'échantillonnage direct
2.7.3. Sur colonie cultivée en culture

2.8. Autres méthodes de diagnostic

2.8.1. Identification chromatographique
2.8.2. Immunochromatographie

2.9. Maldi-TOF dans l'identification des mycobactéries
2.10. Imagerie diagnostique

Module 3. Médicaments et traitements utilisés dans les infections à mycobactéries

3.1. Populations bactériennes à traiter
3.2. Antibiotiques bactéricides

3.2.1. Isoniazide
3.2.2. Rifampicine
3.2.3. Ethambutol
3.2.4. Streptomycine

3.3. Antibiotiques stérilisants

3.3.1. Pyrazinamide
3.3.2. Rifampicine

3.4. Antibiotiques de deuxième ligne

3.4.1. Aminoglycosides
3.4.2. Fluoroquinolones
3.4.3. PAS

3.5. Nouveaux antibiotiques

3.5.1. Linezolid
3.5.2. Lévofloxacine
3.5.3. Autres

3.6. Directives de traitement

3.6.1. Infection tuberculeuse
3.6.2. Infection par d'autres mycobactéries

3.7. Études de sensibilité aux mycobactéries

3.7.1. Indications
3.7.2. Technique des proportions

3.8. Études de sensibilité en milieu liquide
3.9. Études de sensibilité à l'aide de techniques moléculaires
3.10. La résistance aux antibiotiques et son impact sur le traitement des infections mycobactériennes

Module 4. Infections du Mycobacterium Tuberculosis Complex

4.1. Evolution naturelle de la maladie

4.1.1. Immunopathologie

4.2. Pathogénie
4.3. Manifestations cliniques

4.3.1. Critères de diagnostic

4.4. Tuberculose pulmonaire

4.4.1. Tuberculose pulmonaire primaire
4.4.2. Tuberculose pulmonaire post-primaire
4.4.3. Pleurite tuberculeuse

4.5. Tuberculose miliaire
4.6. Tuberculose génito-urinaire
4.7. Tuberculose ostéo-articulaire
4.8. Tuberculose intestinale et péritonite
4.9. Autres formes de tuberculose extrapulmonaire
4.10. Directives de traitement

Module 5. Infections à Mycobactéries non tuberculeux

5.1. Évolution
5.2. Problèmes actuels
5.3. Le Mycobacterium Avium Complex

5.3.1. Espèces incluses dans le complexe
5.3.2. Caractéristiques microbiologiques
5.3.3. Tableau clinique
5.3.4. Traitement

5.4. Mycobacterium Kansasii

5.4.1. Caractéristiques microbiologiques
5.4.2. Tableau clinique
5.4.3. Traitement

5.5. Mycobacterium Ulcerans

5.5.1. Caractéristiques microbiologiques
5.5.2. Tableau clinique
5.3.3. Traitement

5.6. Mycobacterium Genavense

5.6.1. Caractéristiques microbiologiques
5.6.2. Tableau clinique
5.6.3. Traitement

5.7. Mycobacterium Haemophilum

5.7.1. Caractéristiques microbiologiques
5.7.2. Tableau clinique
5.7.3. Traitement

5.8. Mycobacterium Marinum

5.8.1. Caractéristiques microbiologiques
5.8.2. Tableau clinique
5.8.3. Traitement

5.9. Mycobacterium Scrofulaceum

5.9.1. Caractéristiques microbiologiques
5.9.2. Tableau clinique
5.9.3. Traitement

5.10. Mycobacterium Gordonae

5.10.1. Caractéristiques microbiologiques
5.10.2. Tableau clinique
5.10.3. Traitement

Module 6. Autres Infections à Mycobactéries non tuberculeux

6.1. Évolution
6.2. Problèmes actuels
6.3. Mycobacterium Abscessus

6.3.1. Caractéristiques microbiologiques
6.3.2. Tableau clinique
6.3.3. Diagnostic et traitement

6.4. Mycobacterium Chelonae

6.4.1. Caractéristiques microbiologiques
6.4.2. Tableau clinique
6.4.3. Diagnostic et traitement

6.5. Mycobacterium Fortuitum Complex

6.5.1. Caractéristiques microbiologiques
6.5.2. Tableau clinique
6.5.3. Diagnostic et traitement

6.6. Mycobacterium Malmoense

6.6.1. Caractéristiques microbiologiques
6.6.2. Tableau clinique
6.6.3. Diagnostic et traitement

6.7. Mycobacterium Simiae

6.7.1. Caractéristiques microbiologiques
6.7.2. Tableau clinique
6.7.3. Diagnostic et traitement

6.8. Mycobacterium Szulgai

6.8.1. Caractéristiques microbiologiques
6.8.2. Tableau clinique
6.8.3. Traitement

6.9. Mycobacterium Xenopi

6.9.1. Caractéristiques microbiologiques
6.9.2. Tableau clinique
6.9.3. Traitement

6.10. Autres mycobactéries non tuberculeuses

Module 7. Infections mycobactériennes chez les patients VIH

7.1. Épidémiologie de la co-infection TB/VIH
7.2. Tuberculose pulmonaire chez les patients infectés par le VIH avec >200 LTCD4
7.3. Tuberculose extrapulmonaire chez les patients infectés par le VIH avec >200 LTCD4
7.4. Tuberculose chez les patients infectés par le VIH avec< 200 LTCD4
7.5. La méningite tuberculeuse
7.6. Infection mycobactérienne atypique chez le patient VIH
7.7. Diagnostic de l'infection mycobactérienne chez le patient VIH
7.8. Traitement de la Tuberculose chez le patient VIH
7.9. Traitement de l'infection à mycobactéries atypiques chez les patients VIH
7.10. Infection tuberculeuse latente chez le patient VIH Traitement

Module 8. Infections mycobactériennes chez des patients particuliers

8.1. Tuberculose chez les patients néphropathiques
8.2. Tuberculose chez les patients hépatopathes
8.3. Tuberculose chez les patients âgés
8.4. Tuberculose chez les patients traités par des produits biologiques
8.5. Tuberculose chez les patients onco-hématologiques
8.6. Tuberculose chez les patients transplantés d'organes solides (autres que Tx pulm)
8.7. Tuberculose chez les patients présentant une pathologie pulmonaire et ayant subi une transplantation pulmonaire
8.8. Infections à Mycobactéries non tuberculeux chez les immunodéprimés
8.9. Infections à mycobactéries non tuberculeuses chez les patients présentant une pathologie pulmonaire et ayant subi une transplantation pulmonaire
8.10. Prise en charge de la Tuberculose latente chez les patients immunodéprimés

Module 9. Infections mycobactériennes en pédiatrie

9.1. Tuberculose chez l'enfant
9.2. Problèmes actuels de l'infection tuberculeuse de l'enfant
9.3. Clinique Classification du statut de risque pour l'infection par Mycobacterium Tuberculosis Complex

9.3.1. Formes cliniques de la maladie tuberculeuse
9.3.2. Exposition à la tuberculose sans infection
9.3.3. Infection tuberculeuse latente (LTBI)
9.3.4. Maladie tuberculeuse

9.4. Diagnostic de la Tuberculose en Pédiatrie

9.4.1. Dossiers médicaux
9.4.2. Tests immunologiques
9.4.3. Preuve directe de l'identification du Mycobacterium Tuberculosis Complex
9.4.4. Tests radiologiques
9.4.5. Autres tests de diagnostic
9.4.6. Diagnostic différentiel

9.5. Traitement de la Tuberculose en Pédiatrie

9.5.1. Infection tuberculeuse latente (LTBI)
9.5.2. Maladie tuberculeuse
9.5.3. Tuberculose résistante
9.5.4. Surveillance pendant le traitement
9.5.5. Autres mesures thérapeutiques

9.6. Prévention de la Tuberculose en Pédiatrie

9.6.1. Prophylaxie post-exposition
9.6.2. Vaccination

9.7. Situations particulières de la Tuberculose dans le groupe d'âge pédiatrique

9.7.1. Immunodéprimés
9.7.2. Antécédents de vaccination par le BCG
9.7.3. Tuberculose extrapulmonaire
9.7.4. Tuberculose périnatale

9.8. Épidémiologie des infections à mycobactéries atypiques en pédiatrie
9.9. Diagnostic des infections à mycobactéries atypiques en pédiatrie
9.10. Manifestations cliniques et prise en charge thérapeutique des infections à mycobactéries atypiques en pédiatrie

9.10.1. Lymphadénite
9.10.2. Infection pulmonaire
9.10.3. Maladie disséminée

Module 10. Lèpre

10.1. Évolution
10.2. Réservoirs et transmission
10.3. Étiopathogénie
10.4. Épidémiologie
10.5. Classification clinique

10.5.1. Lèpre lépromateuse
10.5.2. Lèpre tuberculoïde
10.5.3. Lèpre Borderline

10.6. Anatomie pathologique
10.7. Diagnostic

10.7.1. Suspicion clinique
10.7.2. Collecte de l'échantillon
10.7.3. Techniques courantes
10.7.4. Techniques moléculaires

10.8. Traitement

10.8.1. Développement des résistances

10.9. Prévention et contrôle
10.10. Aspects pertinents

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