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Module 1. Production en aquaculture

1.1. Aquaculture

1.1.1. Histoire
1.1.2. Types d'aquaculture en fonction de l'organisme à cultiver
1.1.3. Types d'aquaculture par lieu
1.1.4. Aquaculture dans les micro-réservoirs
1.1.5. Systèmes de recirculation en aquaculture

1.2. Qualité de l'eau

1.2.1. L'eau en Aquaculture
1.2.2. Propriétés physiques de l'eau
1.2.3. Critères de qualité de l'eau
1.2.4. Mesures

1.3. Paramètres de qualité de l'eau dans les cultures aquacoles

1.3.1. Paramètres physiques
1.3.2. Paramètres chimiques
1.3.3. Paramètres biologiques

1.4. Types d'Aquaculture

1.4.1. Pisciculture
1.4.2. Élevage de mollusques bivalves
1.4.3. Culture de crustacés

1.5. La culture de la nourriture vivante

1.5.1. Importance de l'alimentation en direct
1.5.2. Utilisation des microalgues comme aliments vivants
1.5.3. Les rotifères comme aliments vivants
1.5.4. Artémia comme nourriture vivante
1.5.5. Autres organismes utilisés comme nourriture vivante

1.6. Aquaponie

1.6.1. Introduction
1.6.2. Systèmes de recirculation aquaponiques
1.6.3. Conception du système de recirculation aquaponique
1.6.4. Espèces utilisées dans ce type de système

1.7. Biosécurité dans les fermes aquacoles

1.7.1. Biosécurité
1.7.2. Mesures visant à réduire le risque d'incursion d'agents pathogènes
1.7.3. Mesures visant à réduire le risque de propagation des agents pathogènes

1.8. Prophylaxie et vaccination en aquaculture

1.8.1. Immunologie
1.8.2. La vaccination comme mesure préventive
1.8.3. Types de vaccins et voies d'administration en aquaculture

1.9. Traitement et gestion des déchets en aquaculture

1.9.1. Gestion des déchets
1.9.2. Caractéristiques des déchets
1.9.3. Stockage des déchets

1.10. L'aquaculture en tant que source de pollution et prévention de la pollution

1.10.1. L'aquaculture continentale comme source de pollution
1.10.2. L'aquaculture marine comme source de pollution
1.10.3. Autres types d'aquaculture en tant que source de pollution
1.10.4. Prévention de la pollution de l'eau dans les activités d'aquaculture continentale
1.10.5. Prévention de la pollution de l'eau dans les activités d'aquaculture marine
1.10.6. Prévention de la pollution de l'eau dans d'autres activités d'aquaculture

Module 2. Physiologie avancée des espèces aquacoles Poissons, mollusques, crustacés, crustacés et algues

2.1. Système sensoriel I

2.1.1. Vision
2.1.2. Audition et équilibre
2.1.3. Capteurs cutanés
2.1.4. Comportement

2.2. Système sensorielles II

2.2.1. Nociception
2.2.2. Chémorécepteurs
2.2.3. Adaptations spéciales

2.3. Système cardiovasculaire des espèces d'aquaculture

2.3.1. Sang Caractéristiques générales et composition
2.3.2. Cellules cardiaques
2.3.3. Mécanismes de contrôle extrinsèques et intrinsèques

2.4. Métabolismes des espèces utilisées en aquaculture

2.4.1. Digestion et assimilation
2.4.2. Processus physiologiques dans le métabolisme des glucides physiologiques
2.4.3. Processus physiologiques dans le métabolisme des lipides
2.4.4. Processus physiologiques dans le métabolisme des protéines
2.4.5. Transport de substances dans l'intestin

2.5. Absorption d'oxygène

2.5.1. Chimiorécepteurs respiratoires
2.5.2. Structure des branchies
2.5.3. Récepteurs extra-branchiaux

2.6. Équilibre osmotique et ionique

2.6.1. Introduction
2.6.2. Équilibre Na+/Cl
2.6.3. Équilibre acide-base
2.6.4. Sécrétion de K+

2.7. Le stress dans les installations d'aquaculture

2.7.1. Définition et concepts
2.7.2. Conséquences du stress
2.7.3. Stress thermique
2.7.4. Le stress social
2.7.5. Gérer le stress

2.8. Système endocrinien

2.8.1. Considérations générales
2.8.2. Organes hypophysaires et endocriniens
2.8.3. Axe hypothalamus-hypophyse-tyroïdeAxe hypothalamus-- thyroïde
2.8.4. Perturbateurs endocriniens

2.9. Physiologie de la peau et anatomophysiologie de la locomotion

2.9.1. Structure tissulaire de la peau
2.9.2. Physiologie de l'os et du cartilage
2.9.3. Muscles
2.9.4. Aspects physiologiques de la locomotion
2.9.5. Flottabilité

2.10. Physiologie appliquée des algues

2.10.1. Structure générale Types
2.10.2. Morphologie cellulaire
2.10.3. Structures associées
2.10.4. Structure interne
2.10.5. Mouvement des algues
2.10.6. Nutrition
2.10.7. Système photorécepteur
2.10.8. Photosynthèse
2.10.9. Interaction des algues dans les cycles biologiques

Module 3. Nutrition dans les fermes aquacoles

3.1. Besoins nutritionnels des organismes aquatiques

3.1.1. Besoins nutritionnels des poissons
3.1.2. Besoins nutritionnels des crustacés
3.1.3. Besoins nutritionnels des mollusques

3.2. Formulation pratique des aliments pour animaux

3.2.1. Formulation de l'alimentation des larves
3.2.2. Formulation des aliments pour animaux d'engraissement
3.2.3. Formulation de l'alimentation des géniteurs

3.3. Qualité des aliments pour animaux et sélection des matières premières

3.3.1. Protéines
3.3.2. Aminoacides
3.3.3. Glucides
3.3.4. Lipides

3.4. Digestibilité des composants alimentaires

3.4.1. Protéine
3.4.2. Aminoacides
3.4.3. Glucides
3.4.4. Lipides

3.5. Formes de présentation des aliments pour les cultures aquacoles

3.5.1. Aliments flottants
3.5.2. Aliments en granulés
3.5.3. Aliments expansés
3.5.4. Aliments extrudés

3.6. Ajout de minéraux, de vitamines et d'autres additifs

3.6.1. Minéraux
3.6.2. Vitamines
3.6.3. Autres additifs

3.7. Microbiote intestinale

3.7.1. L’importance de la microbiote
3.7.2. Composition du microbiote
3.7.3. Facteurs influençant la composition de la microbiote

3.8. Utilisation de probiotiques en aquaculture

3.8.1. Les probiotiques
3.8.2. Effets bénéfiques des probiotiques
3.8.3. Réponse immunitaire au microbiote intestinal
3.8.4. Organismes considérés comme des probiotiques
3.8.5. Quelques problèmes liés à une mauvaise utilisation des probiotiques

3.9. Alimentation vivante: probiotiques et prébiotiques

3.9.1. Aspects bactériens de l'alimentation vivante
3.9.2. Contrôle bactérien dans les cultures d'aliments vivants
3.9.3. Enrichissement de l’alimentation vivante et implications microbiennes
3.9.4. Les probiotiques dans la production d'aliments vivants
3.9.5. Prébiotiques et synbiotiques dans les aliments vivants

3.10. Facteurs antinutritionnels et toxines dans les aliments pour animaux

3.10.1. Thiaminase
3.10.2. Avidine
3.10.3. Inhibiteurs de protéase
3.10.4. Lectines
3.10.5. Phytoestrogènes et phytostérols
3.10.6. Acide phytique
3.10.7. Glucosinolates
3.10.8. Saponines
3.10.9. Alcaloïdes
3.10.10. Mycotoxines

Module 4. Reproduction des espèces aquacoles

4.1. La reproduction des espèces aquacoles

4.1.1. Concepts importants
4.1.2. Types de systèmes reproductifs
4.1.3. Comportement sexuel

4.2. Détermination et différenciation du sexe chez les espèces d'aquaculture

4.2.1. Concept
4.2.2. Détermination génotypique du sexe
4.2.3. Détermination environnementale du sexe
4.2.4. Différenciation sexuelle

4.3. Physiologie de la reproduction I. Mâles

4.3.1. Physiologie et maturation
4.3.2. Spermatogenèse
4.3.3. Hormones testiculaires

4.4. Physiologie de la reproduction II. Femelles

4.4.1. Physiologie et maturation
4.4.2. Ovogenèse
4.4.3. Hormones ovariennes

4.5. Régulation hormonale de la reproduction en aquaculture

4.5.1. Régulation des taux sanguins
4.5.2. Récepteurs thyroïdiens
4.5.3. Structures thyroïdiennes
4.5.4. Hormone thyroïdienne et reproduction

4.6. Fertilisation artificielle en aquaculture

4.6.1. Changements physiologiques au cours du processus de fécondation
4.6.2. Collecte de gamètes
4.6.3. Fertilisation
4.6.4. Incubation
4.6.5. Types de manipulation des chromosomes

4.7. Contrôle environnemental de la reproduction dans les installations d'aquaculture

4.7.1. Photopériode
4.7.2. Température
4.7.3. Application en Aquaculture
4.7.4. Contrôle de la maturation sexuelle

4.8. Cryopréservation

4.8.1. Concepts et objectifs
4.8.2. Cryoconservation du sperme
4.8.3. Cryopréservation d'ovocytes
4.8.4. Cryoconservation d'embryons

4.9. Régime alimentaire et perturbateurs endocriniens dans la reproduction

4.9.1. Effets de différents composants alimentaires
4.9.2. Le niveau de consommation et ses conséquences
4.9.3. Concept de perturbateur endocrinien
4.9.4. Actions des perturbateurs endocriniens

4.10. Reproduction des algues

4.10.1. Caractéristiques physiologiques de la reproduction
4.10.2. Cycle de vie des algues
4.10.3. Types de reproduction
4.10.4. Stockage et conservation

Module 5. Biotechnologie et génétique en Aquaculture

5.1. Biotechnologie, génétique et élevage sélectif en Aquaculture

5.1.1. Histoire de la sélection chez les espèces aquacoles
5.1.2. Historique des applications biotechnologiques chez les espèces aquacoles

5.2. La génétique appliquée aux espèces aquacoles

5.2.1. Caractéristiques qualitatives
5.2.2. Variation phénotypique et influence de l'environnement
5.2.3. Taille de la , population et consanguinité
5.2.4. Génétique des populations: dérive génétique et ses effets

5.3. Clonage et techniques connexes chez les espèces d'Aquaculture

5.3.1. Gynogenèse
5.3.2. Androgenèse
5.3.3. Populations clonées
5.3.4. Clonage par transfert nucléaire

5.4. Stratégies de croisement

5.4.1. Croisement intraspécifique
5.4.2. Hybridation interspécifique

5.5. Sélection génétique: programmes de sélection

5.5.1. Les bases de la sélection génétique
5.5.2. Réponse à la sélection
5.5.3. Sélection des individus et des familles
5.5.4. Caractéristiques en corrélation Sélection indirecte

5.6. Biotechnologie de la reproduction chez les espèces aquacoles

5.6.1. Polyploïdie et xénogenèse
5.6.2. Inversion du sexe et reproduction

5.7. Génomique structurelle de l'aquaculture

5.7.1. Marqueurs moléculaires et cartographie: localisation des gènes
5.7.2. Sélection assistée par marqueurs

5.8. Génomique fonctionnelle de l'Aquaculture

5.8.1. Expression génétique
5.8.2. Implication de l'expression dans la production et les traits physiologiques
5.8.3. Protéomique et applications

5.9. Transfert de gènes et édition de gènes

5.9.1. Génération d'individus transgéniques
5.9.2. Applications de production des individus transgéniques
5.9.3. Biosécurité dans l'utilisation des individus transgéniques
5.9.4. Applications de l'édition de gènes en aquaculture

5.10. Conservation des ressources génétiques des espèces aquacoles

5.10.1. Maintien de la diversité et des écosystèmes: contribution de l'aquaculture
5.10.2. Les banques de ressources génétiques en aquaculture

Module 6. Pathologie Maladies et troubles les plus fréquents en Aquaculture

6.1. Pathologie en aquaculture

6.1.1. Concepts importants
6.1.2. Importance du système immunitaire
6.1.3. Maladies infectieuses
6.1.4. Maladies parasitaires
6.1.5. Maladies nutritionnelles
6.1.6. Autres causes de maladie

6.2. Maladies bactériennes

6.2.1. Symptomes généraux Méthodes de diagnostic et traitement
6.2.2. Flavobactéries
6.2.3. Enterobacteriaceae
6.2.4. Aeromonas
6.2.5. Pseudomonas

6.3. Maladies bactériennes II

6.3.1. Mycobactéries
6.3.2. Photobactéries
6.3.3. Flexibactéries
6.3.4. Chlamydias
6.3.5. Autres bactéries

6.4. Maladies fongiques

6.4.1. Symptomes généraux Méthodes de diagnostic et traitement
6.4.2. Oomycètes
6.4.3. Chytridiomycetes
6.4.4. Zygomycètes
6.4.5. Deutéromycètes

6.5. Maladies virales I

6.5.1. symptômes Méthodes de diagnostic et traitement
6.5.2. Maladies virales à déclaration obligatoire (NOD)
6.5.3. Nécrose hématopoïétique épizootique
6.5.4. Nécrose hématopoïétique infectieuse
6.5.5. Septicémie hémorragique virale
6.5.6. Nécrose pancréatique infectieuse

6.6. Maladies virales II

6.6.1. Anémie infectieuse du saumon
6.6.2. Koi Herpervirus
6.6.3. Encéphalopathie et rétinopathie virale
6.6.4. Lymphocytes
6.6.5. Maladies du pancréas et du sommeil
6.6.6. Autres maladies virales

6.7. Maladies parasitaires

6.7.1. Symptômes, Méthodes de diagnostic et Traitement
6.7.2. Protistes
6.7.3. Metazoos

6.8. Maladies nutritionnelles

6.8.1. Considérations importantes sur la relation entre la nutrition et ses pathologies
6.8.2. Causes de la famine
6.8.3. Carences en protéines, lipides et glucides
6.8.4. Carence en vitamines
6.8.5. Carence en minéraux
6.8.6. Les substances toxiques et leurs effets sur les aliments

6.9. Tumeurs Malignes

6.9.1. Importance des processus néoplasiques
6.9.2. Tumeurs d'origine épithéliale
6.9.3. Tumeurs d'origine mésenchymateuse
6.9.4. Tumeurs hématopoïétiques
6.9.5. Autres processus tumoraux

6.10. Autres maladies non-infectieuses

6.10.1. Lésions traumatiques
6.10.2. Maladie due au stress thermique
6.10.3. Pathologies liées au stress social
6.10.4. Maladie des bulles de gaz
6.10.5. Produits irritants
6.10.6. Déformations physiques
6.10.7. Altérations génétiques
6.10.8. Maladies causées par les algues

Module 7. Installations d'Aquaculture Types, conception et gestion

7.1. Caractéristiques générales des différents types d'installations

7.1.1. Production aquacole continentale
7.1.2. Structures d'une installation continentale
7.1.3. Localisation des installations
7.1.4. Production aquacole marine
7.1.5. Structures d'une installation maritime
7.1.6. Localisation des installations
7.1.7. Production d'aquaculture ornementale

7.2. Installations terrestres Eau

7.2.1. Captage d'eau
7.2.2. Systèmes de pompage
7.2.3. Systèmes de recirculation
7.2.4. Distribution d'eau
7.2.5. Étangs Circulation de l'eau dans les étangs

7.3. Filtration et oxygénation dans les installations terrestres

7.3.1. Méthodes de filtration
7.3.2. Biofiltration
7.3.3. Aération de l'eau
7.3.4. Oxygénation de l'eau Besoins en oxygène

7.4. Installations maritimes

7.4.1. Aspects importants
7.4.2. Types d’enclos marins
7.4.3. Courants, vent et vagues
7.4.4. Stress sur les installations maritimes

7.5. Gestion et organisation de différents types d'installations

7.5.1. Installations d'engraissement
7.5.2. Installations de reproduction
7.5.3. Installations de pré-engraissement
7.5.4. Installations pour les espèces ornementales

7.6. Entretien des installations

7.6.1. Conduites d'eau
7.6.2. Systèmes d'aération et d'oxygénation
7.6.3. Système d'alimentation
7.6.4. Structures auxiliaires

7.7. Croissance

7.7.1. Utilisation des lots
7.7.2. Biomasse
7.7.3. Détermination du nombre d'étangs par lot
7.7.4. Fractionnement et calibrage
7.7.5. Suivi de la croissance

7.8. Contrôle des blessés

7.8.1. Plan de santé
7.8.2. Echappatoires
7.8.3. Victimes Causes

7.9. Commercialisation du produit final

7.9.1. Planification des ventes
7.9.2. Abattage et transformation
7.9.3. Qualité et traçabilité des produits
7.9.4. Commercialisation

7.10. Aquaculture et développement durable

7.10.1. Utilisation des stocks silvestres
7.10.2. Matière organique dans les effluents
7.10.3. Contagion par les agents pathogènes
7.10.4. Utilisation de médicaments et de leurs résidus
7.10.5. Résidus alimentaires
7.10.6. Effets sur l'environnement et la faune locale

Module 8. Réglementation du secteur de l'Aquaculture

8.1. Cadre juridique de l'Aquaculture

8.1.1. L’Aquaculture
8.1.2. La sécurité juridique et le degré de développement de la réglementation
8.1.3. Régime juridique
8.1.4. Domaines de réglementation

8.2. Législation relative à l'Aquaculture

8.2.1. Réglementations spécifiques
8.2.2. Législation généralement applicable
8.2.3. Réglementation environnementale
8.2.4. Législation sur la santé animale
8.2.5. Réglementation en matière de santé et d'hygiène
8.2.6. Réglementation en matière d'hygiène et de santé
8.2.7. Autres réglementations concernées

8.3. Réglementation de l'Aquaculture dans l'Union Européenne

8.3.1. L’Aquaculture européenne
8.3.2. La stratégie pour le développement durable de l'Aquaculture Européenne
8.3.3. Les orientations stratégiques pour le développement durable de l'Aquaculture Européenne
8.3.4. Résolutions du Parlement Européen)

8.4. Organisations internationales

8.4.1. Union européenne (UE)
8.4.2. Organisation Mondiale du Commerce (OMC)
8.4.3. Organisation Mondiale de la Santé (OMS)
8.4.4. Organisation Mondiale de la Santé Animale (OIE)
8.4.5. Conseil International pour l'Exploration de la Mer (CIEM)

8.5. Organisation des Nations Unies pour l'Alimentation et l'Agriculture (FAO)

8.5.1. Organisation des Nations Unies pour l'Alimentation et l'Agriculture (FAO)
8.5.2. La FAO et l'Aquaculture
8.5.3. La Commission de la Pêche (COFI)
8.5.4. Sous-comité sur l'aquaculture du COFI
8.5.5. Le Code de conduite pour une pêche responsable

8.6. Entités et partenariats internationaux

8.6.1. World Aquaculture Society
8.6.2. Autres sociétés et organismes d'Aquaculture

Module 9. Structure et gestion économiques

9.1. Introduction

9.1.1. La production de capture
9.1.2. La production en Aquaculture
9.1.3. Les premières conclusions

9.2. L'importance quantitative et qualitative de l'aquaculture dans le monde

9.2.1. Introduction
9.2.2. L'évolution de l'Aquaculture mondiale
9.2.3. La localisation de l'Aquaculture
9.2.4. Ses perspectives quantitatives et qualitatives
9.2.5. Les premières conclusions

9.3. Importance quantitative et qualitative dans l’Union Européenne

9.3.1. Introduction
9.3.2. Importance relative et absolue
9.3.3. Principales forces et faiblesses
9.3.4. Ses perspectives quantitatives et qualitatives
9.3.5. Les premières conclusionss

9.4. La finance dans l'entreprise aquacole

9.4.1. Introduction
9.4.2. Les sources de financement: leur intérêt
9.4.3. La politique et le coût des emprunts
9.4.4. Structure et sources de l'endettement
9.4.5. Autofinancement
9.4.6. Les premières conclusions

9.5. Le compte de profits et pertes et les flux économiques dans l'entreprise d'aquaculture

9.5.1. Introduction
9.5.2. Le compte de résultat
9.5.3. Flux de trésorerie économiques et financiers
9.5.4. Valeur ajoutée
9.5.5. Les premières conclusions

9.6. L'analyse des fonds propres et des finances de l'entreprise d'Aquaculture

9.6.1. Introduction
9.6.2. Conditions préalables
9.6.3. Organisation du bilan
9.6.4. Analyse de l'évolution du bilan
9.6.5. Conclusions Ad hoc

9.7. Ratios économiques à prendre en compte dans l'Aquaculture

9.7.1. Introduction
9.7.2. La valeur relative des ratios
9.7.3. Types de ratios
9.7.4. Ratios d'évaluation de la rentabilité
9.7.5. Ratios d'évaluation de la liquidité
9.7.6. Ratios d'évaluation de l'endettement
9.7.7. Les premières conclusions

9.8. Analyse économique en Aquaculture

9.8.1. Introduction
9.8.2. Structure et fonctionnement des comptes comptables
9.8.3. Comptes d'actif et de passif
9.8.4. Comptes d'écart
9.8.5. Comptes de profits et pertes
9.8.6. Audits
9.8.7. Considérations supplémentaires

Module 10. Modèles de culture en aquaculture

10.1. Modèles continentaux I

10.1.1. Culture de cyprinidés
10.1.2. Culture du tilapia

10.2. Modèles continentaux II

10.2.1. Élevage de Truites
10.2.2. Élevage du Saumon

10.3. Modèles d'Aquaculture marine I

10.3.1. Élevage de daurades
10.3.2. Élevage du bar

10.4. Modèles d'Aquaculture marine II

10.4.1. Élevage du Turbot
10.4.2. L'élevage du Thon

10.5. Modèles d'élevage de mollusques

10.5.1. Culture de Palourdes
10.5.2. Culture de Moules

10.6. Modèle de culture de crustacés

10.6.1. Élevage de Crevettes
10.6.2. Élevage de Gambas

10.7. Modèles de culture pour l'Aquaculture ornementale. Espèces d'eau douce I

10.7.1. Culture de vivipares
10.7.2. Culture des cichlidés d'Amérique du Sud
10.7.3. Culture de cichlidés africains

10.8. Modèles de culture pour l'Aquaculture ornementale. Espèces d'eau douce II

10.8.1. Culture de cichlidés africains
10.8.2. Culture de Poissons Discus
10.8.3. Culture de la Carpe koï
10.8.4. Culture d'autres espèces d'eau douce

10.9. Modèles Aquaculture ornementale. Espèces d'eau salée

10.9.1. Culture de Poissons-Clowns
10.9.2. Culture de Paracanthurus Hepatus
10.9.3. Culture de Pterapogon Kauderni
10.9.4. Culture de macro et microalgues

10.10. Autres modèles d'élevage aquacole

10.10.1. Culture de microalgues
10.10.2. Culture de macroalgues
10.10.3. La culture de la nourriture vivante

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