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Die Darmmikrobiota spielt eine entscheidende Rolle bei zahlreichen biologischen Prozessen, wie z. B. bei der Nahrungsverdauung, der Nährstoffaufnahme, dem Stoffwechsel, der Regulierung des Immunsystems und der Prävention von Krankheiten. Dies hat sie zu einem Gegenstand von wachsendem wissenschaftlichem Forschungsinteresse gemacht, da ihre Auswirkungen auf die menschliche Gesundheit tiefgreifend und komplex sind.

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Modul 1. Mikrobiota. Mikrobiom. Metagenomik

1.1. Definition und Beziehung zwischen ihnen
1.2. Zusammensetzung der Mikrobiota: Gattungen, Arten und Stämme

1.2.1. Gruppen von Mikroorganismen, die mit der menschlichen Spezies interagieren: Bakterien, Pilze, Viren und Protozoen
1.2.2. Schlüsselbegriffe: Symbiose, Kommensalismus, Mutualismus, Parasitismus
1.2.3. Einheimische Mikrobiota

1.3. Verschiedene menschliche Mikroben. Allgemeine Informationen über Eubiose und Dysbiose

1.3.1. Gastrointestinale Mikrobiota 
1.3.2. Orale Mikrobiota 
1.3.3. Hautmikrobiota 
1.3.4. Mikrobiota des Respirationstraktes 
1.3.5. Mikrobiota des Harntrakts 
1.3.6. Mikrobiota des Fortpflanzungstraktes

1.4. Faktoren, die das Gleichgewicht und Ungleichgewicht der Mikrobiota beeinflussen

1.4.1. Ernährung und Lebensstil. Darm-Hirn-Achse 
1.4.2. Antibiotika-Therapie 
1.4.3. Interaktion zwischen Epigenetik und Mikrobiota. Endokrine Disruptoren 
1.4.4. Probiotika, Präbiotika, Symbiotika. Konzepte und Allgemeinheiten 
1.4.5. Fäkaltransplantation, jüngste Fortschritte

Modul 2. Darmmikrobiota I. Intestinale Homöostase

2.1. Studien zur Darmmikrobiota

2.1.1. Projekte Metahit, Meta-Biome, MyNewGut, Human Microbiome Project

2.2. Zusammensetzung der Mikrobiota

2.2.1. Schützende Mikrobiota (Lactobacillus, Bifidobacterium, Bacteroides) 
2.2.2. Immunmodulierende Mikrobiota (Enterococcus faecalis und Escherichia coli) 
2.2.3. Mukonutritive oder mukoprotektive Mikrobiota (Faecalibacterium prausnitzii und Akkermansia muciniphila)
2.2.4. Mikrobiota mit proteolytischen oder proinflammatorischen Aktivitäten (E. coli Biovare, Clostridium, Proteus, Pseudomonas, Enterobacter, Enterobacter, Citrobacter, Klebsiella, Desulfovibrio, Bilophila) 
2.2.5. Pilzmikrobiota (Candida, Geotrichum)

2.3. Physiologie des Verdauungssystems. Zusammensetzung der Mikrobiota in den verschiedenen Teilen des Verdauungstrakts. Residente Flora und transiente oder kolonisierende Flora. Sterile Bereiche im Verdauungstrakt

2.3.1. Ösophagus-Mikrobiota

2.3.1.1. Gesunde Personen
2.3.1.2. Patienten (Magenreflux, Barrett-Ösophagus usw.)

2.3.2. Mikrobiota des Magens

2.3.2.1. Gesunde Personen 
2.3.2.2. Patienten (Magengeschwüre, Magenkrebs, MALT usw.)

2.3.3. Mikrobiota der Gallenblase

2.3.3.1. Gesunde Personen 
2.3.3.2. Patienten (Cholezystitis, Cholelithiasis usw.)

2.3.4. Mikrobiota des Dünndarms

2.3.4.1. Gesunde Personen 
2.3.4.2. Patienten (entzündliche Darmerkrankungen, Reizdarmsyndrom usw.)

2.3.5. Dickdarm-Mikrobiota

2.3.5.1. Gesunde Personen. Enterotypen 
2.3.5.2. Patienten (entzündliche Darmerkrankungen, Morbus Crohn, Kolonkarzinom, Blinddarmentzündung usw.)

2.4. Funktionen der Darmmikrobiota: Metabolisch. Ernährungs- und trophische Funktionen. Schutz und Immunbarriere

2.4.1. Wechselbeziehungen zwischen der Darmmikrobiota und entfernten Organen (Gehirn, Lunge, Herz, Leber, Bauchspeicheldrüse usw.)

2.5. Die Darmschleimhaut und das Immunsystem der Schleimhäute

2.5.1. Anatomie, Merkmale und Funktionen (MALT-, GALT- und BALT-System)

2.6. Was ist Darmhomöostase? Die Rolle der Bakterien in der Darmhomöostase

2.6.1. Auswirkungen auf Verdauung und Ernährung 
2.6.2. Stimulierung der Abwehrkräfte, wodurch die Besiedlung durch pathogene Mikroorganismen verhindert wird 
2.6.3. Produktion von B- und K-Vitaminen 
2.6.4. Produktion von kurzkettigen Fettsäuren (Buttersäure, Propionsäure, Essigsäure usw.) 
2.6.5. Erzeugung von Gasen (Methan, Kohlendioxid, molekularer Wasserstoff), Eigenschaften und Funktionen 
2.6.6. Milchsäure

Modul 3. Darmmikrobiota II. Dysbiose im Darm

3.1. Was ist intestinale Dysbiose? Konsequenzen
3.2. Die Darmbarriere. Physiologie. Funktion. Intestinale Permeabilität und intestinale Hyperpermeabilität. Beziehung zwischen intestinaler Dysbiose und intestinaler Hyperpermeabilität
3.3. Zusammenhang zwischen Darmdysbiose und anderen Arten von Erkrankungen: immunologische, metabolische, neurologische und Magenerkrankungen (Helicobacter Pylori)
3.4. Die Folgen der Veränderung des intestinalen Ökosystems und ihre Beziehung zu funktionellen Verdauungsstörungen

3.4.1. Entzündliche Darmerkrankung IBD 
3.4.2. Chronisch entzündliche Darmerkrankungen: Morbus Crohn. Colitis ulcerosa 
3.4.3. Reizdarmsyndrom (IBS) und Diveticulose 
3.4.4. Störungen der intestinalen Motilität. Durchfall. Durchfall verursacht durch Clostridium difficile. Verstopfung 
3.4.5. Verdauungsstörungen und Störungen der Nährstoff-Malabsorption: Kohlenhydrate, Proteine und Fette 
3.4.6. Marker für Darmentzündungen: Calprotectin. Eosinophiles Protein (Epx). Lactoferrin. Lysozym 
3.4.7. Leaky-Gut-Syndrom. Permeabilitätsmarker: Alpha 1 Antitrypsin. Zonulin. Tight Junctions und ihre Hauptfunktion

3.5. Veränderung des intestinalen Ökosystems und sein Zusammenhang mit Darminfektionen

3.5.1. Virusbedingte Darminfektionen
3.5.2. Bakterielle Darminfektionen 
3.5.3. Darminfektionen aufgrund von Parasiten 
3.5.4. Pilzinfektionen des Darms. Intestinale Candidose

3.6. Zusammensetzung der Darmmikrobiota in verschiedenen Lebensabschnitten

3.6.1. Unterschiede in der Zusammensetzung der Darmmikrobiota von der Neugeborenen- und frühen Kindheit bis zur Adoleszenz. „Instabiles Stadium"
3.6.2. Zusammensetzung der Darmmikrobiota im Erwachsenenalter. „Stabiles Stadium" 
3.6.3. Zusammensetzung der intestinalen Mikrobiota bei älteren Menschen. „Instabiles Stadium". Alterung und Mikrobiota

3.7. Ernährungsbedingte Modulation von Dysbiose und Hyperpermeabilität des Darms: Glutamin, Zink, Vitamine, Probiotika, Präbiotika
3.8. Techniken für die quantitative Analyse von Mikroorganismen in Fäkalien
3.9. Aktuelle Forschungslinien

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