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Módulo 1. Biologia molecular

1.1. Mecanismos moleculares do câncer

1.1.1. Ciclo celular
1.1.2. Destacamento de células tumorais

1.2. Reprogramação do microambiente tumoral

1.2.1. O microambiente do tumor: uma visão geral
1.2.2. O TME como um fator prognóstico no câncer de pulmão
1.2.3. O TME na progressão e metástase do câncer de pulmão

1.2.3.1. Fibroblastos associados ao câncer (CAF)
1.2.3.2. Células endoteliais
1.2.3.3. Hipoxia no câncer de pulmão
1.2.3.4. Inflamação
1.2.3.5. Células imunológicas

1.2.4. Contribuição do TME na resistência terapêutica

1.2.4.1. Contribuição do TME na resistência à radioterapia

1.2.5. O TME como um alvo terapêutico no câncer de pulmão

1.2.5.1. Direções futuras

1.3. Imunologia tumoral: Fundamentos da imunoterapia contra o câncer

1.3.1. Introdução ao sistema imunológico
1.3.2. Imunologia tumoral

1.3.2.1. Antígenos associados aos tumores
1.3.2.2. Identificação de antígenos associados aos tumores
1.3.2.3. Tipos de antígenos associados aos tumores

1.3.3. Fundamentos da imunoterapia contra o câncer

1.3.3.1. Introdução às abordagens imunoterapêuticas
1.3.3.2. Anticorpos monoclonais na terapia do câncer

1.3.3.2.1. Produção de anticorpos monoclonais
1.3.3.2.2. Tipos de anticorpos terapêuticos
1.3.3.2.3. Mecanismos de ação dos anticorpos
1.3.3.2.4. Anticorpos modificados

1.3.4. Moduladores imunes não específicos

1.3.4.1. Bacilo de Calmette Guérin
1.3.4.2. Interferon-α
1.3.4.3. Interleucina-2
1.3.4.4. Imiquimode

1.3.5. Outras abordagens da imunoterapia

1.3.5.1. Vacinas contra células dendríticas
1.3.5.2. Sipuleucel-T
1.3.5.3. Bloqueio CTLA-4
1.3.5.4. Terapia de células T adotivas

1.3.5.4.1. Terapia celular adotiva com clones de células T
1.3.5.4.2. Terapia celular adotiva com linfócitos infiltrantes tumorais

1.4. Mecanismos moleculares envolvidos no processo de invasão e metástase

Módulo 2. Genômica ou oncologia de precisão

2.1. Utilidade do perfil de expressão gênica no câncer
2.2. Subtipos moleculares do câncer de mama
2.3. Plataformas genômicas prognósticas-preditivas no câncer de mama
2.4. Alvos terapêuticos no câncer de pulmão de células não pequenas

2.4.1. Introdução
2.4.2. Técnicas de detecção molecular
2.4.3. Mutação EGFR
2.4.4. Translocação ALK
2.4.5. Translocação ROS
2.4.6. Mutação BRAF
2.4.7. Rearranjos dos NRTK
2.4.8. Mutação HER2
2.4.9. Mutação/Amplificação de MET
2.4.10. Rearranjos do RET
2.4.11. Outros alvos moleculares

2.5. Classificação molecular do câncer de cólon
2.6. Estudos moleculares em câncer gástrico

2.6.1. Tratamento do câncer gástrico avançado
2.6.2. Superexpressão do HER2 em câncer gástrico avançado
2.6.3. Determinação e interpretação da superexpressão do HER2 em câncer gástrico avançado
2.6.4. Medicamentos com atividade direcionada ao HER2
2.6.5. Trastuzumab de primeira linha no câncer gástrico avançado

2.6.5.1. Tratamento do câncer gástrico avançado HER2+ após a progressão para regimes baseados em trastuzumab
2.6.6. Atividade de outros medicamentos anti-HER2 no câncer gástrico avançado

2.7. GIST como modelo para a pesquisa translacional: 15 anos de experiência

2.7.1. Introdução
2.7.2. Mutações do KIT e PDGFRA como principais promotores no GIST
2.7.3. Genótipo em GIST: valor prognóstico e preditivo
2.7.4. Genótipo em GIST e resistência imatinibe
2.7.5. Conclusões

2.8. Biomarcadores moleculares e genômicos no melanoma
2.9. Classificação molecular dos tumores cerebrais
2.10. Biomarcadores moleculares e genômicos no melanoma
2.11. Imunoterapia e biomarcadores

2.11.1. O cenário das terapias imunológicas no tratamento do câncer e a necessidade de definir o perfil mutacional de um tumor
2.11.2. Biomarcadores de inibidor de ponto de controle: PD-L1 e mais

2.11.2.1. O papel da PD-L1 na regulamentação imunológica
2.11.2.2. Dados de ensaios clínicos e biomarcador PD-L1
2.11.2.3. Os limites e ensaios para a expressão PD-L1: um quadro complexo
2.11.2.4. Biomarcadores emergentes

2.11.2.4.1. Carga Mutacional Tumoral (TMB)

2.11.2.4.1.1. Quantificação da carga mutacional tumoral
2.11.2.4.1.2. Evidência da carga mutacional tumoral
2.11.2.4.1.3. A carga tumoral como biomarcador preditivo
2.11.2.4.1.4. A carga como um biomarcador prognóstico
2.11.2.4.1.5. O futuro da carga mutacional

2.11.2.4.2. Instabilidade dos microssatélites
2.11.2.4.3. Análise de infiltração imune
2.11.2.4.4. Marcadores de toxicidade

2.11.3. Desenvolvimento de medicamentos de ponto de controle imunológico no câncer
2.11.4. Medicamentos disponíveis

Módulo 3. Mudanças na prática clínica atual e novas aplicações com a genômica oncológica

3.1. Biópsias líquidas: moda ou futuro?

3.1.1. Introdução
3.1.2. Células tumorais circulantes
3.1.3. ctDNA
3.1.4. Utilidades clínicas
3.1.5. Limitações do ctDNA
3.1.6. Conclusões e futuro

3.2. Papel do Biobanco na pesquisa clínica

3.2.1. Introdução
3.2.2. Vale a pena o esforço para montar um Biobanco?
3.2.3. Como começar a montar um Biobanco?
3.2.4. Consentimento informado para o Biobanco
3.2.5. Coleta de amostras para Biobanco
3.2.6. Controle de Qualidade
3.2.7. Acesso às amostras

3.3. Ensaios clínicos: novos conceitos baseados na medicina de precisão

3.3.1. O que são ensaios clínicos? Como se diferenciam de outros tipos de pesquisa?

3.3.1.1. Tipos de ensaios clínicos

3.3.1.1.1. De acordo com os objetivos
3.3.1.1.2. De acordo com o número de centros participantes
3.3.1.1.3. De acordo com a metodologia
3.3.1.1.4. De acordo com o grau de mascaramento

3.3.2. Resultados de ensaios clínicos em oncologia torácica

3.3.2.1. Relacionado ao tempo de sobrevivência
3.3.2.2. Resultados relacionados a tumores
3.3.2.3. Resultados relatados pelos pacientes

3.3.3. Ensaios clínicos na era da medicina de precisão

3.3.3.1. Medicina de precisão
3.3.3.2. Terminologia relacionada ao desenho de ensaios na era da medicina de precisão

3.4. Incorporação de marcadores acionáveis na prática clínica
3.5. Aplicação da genômica na prática clínica por tipo de tumor
3.6. Sistemas de apoio à tomada de decisão em oncologia baseados em Inteligência Artificial

Módulo 4. Uso de Unix e Linux na bioinformática

4.1. Introdução ao sistema operacional Linux

4.1.1. O que é um sistema operacional?
4.1.2. Os benefícios do uso do Linux

4.2. Ambiente Linux e instalação

4.2.1. Distribuições Linux
4.2.2. Instalação do Linux usando um dispositivo USB
4.2.3. Instalação do Linux usando CD-ROM
4.2.4. Instalação do Linux usando uma máquina virtual

4.3. A linha de comando

4.3.1. Introdução
4.3.2. O que é uma linha de comando?
4.3.3. Trabalhando no terminal
4.3.4. O Shell, Bash

4.4. Navegação básica

4.4.1. Introdução
4.4.2. Como saber a localização atual?
4.4.3. Rotas absolutas e relativas
4.4.4. Como nos movemos no sistema?

4.5. Manipulação de arquivos

4.5.1. Introdução
4.5.2. Como construímos um diretório?
4.5.3. Como mudar para um diretório?
4.5.4. Como criar um arquivo vazio?
4.5.5. Copiar um arquivo e diretório
4.5.6. Eliminar um arquivo e diretório

4.6. Editor de texto Vi

4.6.1. Introdução
4.6.2. Como salvar e sair?
4.6.3. Como navegar por um arquivo no editor de texto Vi?
4.6.4. Apagando o conteúdo
4.6.5. O comando desfazer

4.7. Curingas (Wildcards)

4.7.1. Introdução
4.7.2. O que são curingas?
4.7.3. Exemplos de curingas

4.8. Permissões

4.8.1. Introdução
4.8.2. Como visualizar as permissões de um arquivo?
4.8.3. Como alterar as permissões?
4.8.4. Configuração das permissões
4.8.5. Permissões para diretórios
4.8.6. O usuário "root”

4.9. Filtros

4.9.1. Introdução
4.9.2. Head
4.9.3. Tail
4.9.4. Sort
4.9.5. nl
4.9.6. wc
4.9.7. cut
4.9.8. sed
4.9.9. uniq
4.9.10. tac
4.9.11. Outros filtros

4.10. Grep e expressões regulares

4.10.1. Introdução
4.10.2. eGrep
4.10.3. Expressões regulares
4.10.4. Alguns exemplos

4.11. Canalização e Redirecionamentos

4.11.1. Introdução
4.11.2. Redirecionamento para um arquivo
4.11.3. Salvar em um arquivo
4.11.4. Redirecionamento a partir de um arquivo
4.11.5. Redirecionamento STDERR
4.11.6. Canalização (Pipelines)

4.12. Manejo de processos

4.12.1. Introdução
4.12.2. Processos ativos
4.12.3. Encerrar um processo corrompido
4.12.4. Trabalho de primeiro e segundo plano

4.13. Bash

4.13.1. Introdução
4.13.2. Pontos importantes
4.13.3. Por que o "./ ”?
4.13.4. Variáveis
4.13.5. As declarações

Módulo 5. Análise de dados em projetos de Big Data: linguagem de programação R

5.1. Introdução à linguagem de programação R

5.1.1. O que é R?
5.1.2. Instalação do R e da interface gráfica R
5.1.3. Pacotes

5.1.3.1. Pacotes standard
5.1.3.2. Pacotes contribuídos e CRAN

5.2. Características básicas do R

5.2.1. O ambiente R
5.2.2. Software e documentação relacionados
5.2.3. R e estatísticas
5.2.4. R e o sistema de janelas
5.2.5. Usando R interativamente
5.2.6. Uma sessão introdutória
5.2.7. Obtendo ajuda com funções e características
5.2.8. Comandos R, sensibilidade a maiúsculas, etc.
5.2.9. Recuperação e correção de comandos anteriores
5.2.10. Executar comandos ou desviar a saída para um arquivo
5.2.11. Permanência de dados e eliminação de objetos

5.3. Tipos de objetos R

5.3.1. Manipulações simples; números e vetores

5.3.1.1. Vetores e atribuições
5.3.1.2. Aritmética vetorial
5.3.1.3. Gerando sequências regulares
5.3.1.4. Vetores lógicos
5.3.1.5. Valores perdidos
5.3.1.6. Vetores de caracteres
5.3.1.7. Vetores de índice

5.3.1.7.1. Seleção e modificação de subconjuntos de um conjunto de dados

5.3.1.8. Outros tipos de objetos

5.3.2. Objetos, modos e atributos

5.3.2.1. Atributos intrínsecos: modo e comprimento
5.3.2.2. Mudando o comprimento de um objeto
5.3.2.3. Coleta e configuração de atributos
5.3.2.4. A classe de um objeto

5.3.3. Fatores ordenados e não ordenados

5.3.3.1. Um exemplo específico
5.3.3.2. A função tapply () e as matrizes desiguais
5.3.3.3. Fatores ordenados

5.3.4. Matrizes

5.3.4.1. Matrizes
5.3.4.2. Indexação de matrizes Subseções de uma matriz
5.3.4.3. Matrizes do índice
5.3.4.4. A função array ()
5.3.4.5. Aritmética mista de vetor e matriz. A regra da reciclagem
5.3.4.6. O produto externo de duas matrizes
5.3.4.7. Transposição de matriz generalizada
5.3.4.8. Multiplicação de matrizes
5.3.4.9. Valores próprios e vetores próprios
5.3.4.10. Decomposição de valores singulares e determinantes
5.3.4.11. Capacitação de matrizes particionadas, cbind () e rbind ()
5.3.4.12. A função de concatenação, c (), com matrizes

5.3.5. Tabelas de frequência de fatores
5.3.6. Listas

5.3.6.1. Construção e modificação de listas
5.3.6.2. Listas de concatenação

5.3.7. DataFrames

5.3.7.1. Como criar DataFrames?
5.3.7.2. Anexar () e separar ()
5.3.7.3. Trabalhando com DataFrames

5.4. Leitura e escrita de dados

5.4.1. A função read.table ()
5.4.2. A função scan()
5.4.3. Acesso aos conjuntos de dados incorporados
5.4.4. Carregando dados de outros pacotes R
5.4.5. Edição de dados

5.5. Agrupamento, loops e execução condicional

5.5.1. Expressões agrupadas
5.5.2. Declarações de controle

5.5.2.1. Execução condicional: sentenças IF
5.5.2.2. Execução repetitiva: para loops, repetição e tempo

5.6. Escrevendo suas próprias funções

5.6.1. Exemplos simples
5.6.2. Definição de novos operadores binários
5.6.3. Argumentos com nome e valores padrão
5.6.4. O argumento "..."0
5.6.5. Atribuições dentro das funções

Módulo 6. Ambiente gráfico em R

6.1. Procedimentos gráficos

6.1.1. Comandos de traçado de alto nível

6.1.1.1. A função de plot ()
6.1.1.2. Visualização de dados multivariados
6.1.1.3. Gráficos de tela
6.1.1.4. Argumentos para funções de traçado de alto nível

6.1.2. Comandos de traçado de alto nível

6.1.2.1. Anotação matemática
6.1.2.2. Fontes vetoriais Hershey

6.1.3. Interagindo com os gráficos
6.1.4. Uso de parâmetros gráficos

6.1.4.1. Mudanças permanentes: a função par ()
6.1.4.2. Mudanças temporais: Argumentos às funções gráficas

6.1.5. Lista de parâmetros gráficos

6.1.5.1. Elementos gráficos
6.1.5.2. Eixos e marcações
6.1.5.3. Margens da figura
6.1.5.4. Ambiente com múltiplas imagens

6.1.6. Estatística descritiva: Representações gráficas

Módulo 7. Análise estatística em R

7.1. Distribuições discretas de probabilidade
7.2. Distribuições contínuas de probabilidade
7.3. Introdução à inferência e amostragem (estimativa pontual)
7.4. Intervalos de confiança
7.5. Teste de hipótese
7.6. ANOVA de um fator
7.7. Bondade de ajuste (teste de qui-quadrado)
7.8. Pacote fitdist
7.9. Introdução às estatísticas multivariadas

Módulo 8. Machine Learning para a análise de Big Data

8.1. Introdução a Machine Learning
8.2. Apresentação de problemas, carregamento de dados e bibliotecas
8.3. Limpeza de dados (NAs, categorias, variáveis dummy)
8.4. Análise de dados exploratórios (ggplot) + Validação cruzada
8.5. Algoritmos de previsão: Regressão Linear Múltipla, Máquina de Suporte Vetorial, Árvores de Regressão, Random Forest…
8.6. Algoritmos de classificação: Regressão Logística, Support Vector Regression, Árvores de Regressão, Random Forest…
8.7. Ajuste dos hiperparâmetros do algoritmo
8.8. Predição de dados com os diferentes modelos
8.9. Curvas ROC e Matrizes de Confusão para avaliar a qualidade do modelo

Módulo 9. Mineração de dados aplicada à genômica

9.1. Introdução
9.2. Inicialização de variáveis
9.3. Limpeza e condicionamento do texto
9.4. Geração da matriz de termos

9.4.1. Criação da matriz de termos TDM
9.4.2. Visualizações sobre a matriz de palavras TDM

9.5. Descrição da matriz de termos

9.5.1. Representação gráfica das frequências
9.5.2. Construção de uma nuvem de palavras

9.6. Criação de um Data Frame apto para K-NN
9.7. Construção do modelo de classificação
9.8. Validação do Mmodelo de classificação
9.9. Exercício prático guiado sobre mineração de dados em genômica do câncer

Módulo 10. Técnicas de mineração de dados genômicos

10.1. Introdução ao "scraping data”
10.2. Importação de arquivos de dados de planilhas armazenadas online
10.3. Raspagem de texto HTML
10.4. Raspagem de dados de uma tabela HTML
10.5. Aproveitando as APIs para raspagem de dados
10.6. Extraindo informações relevantes
10.7. Usando o pacote rvest em R
10.8. Obtenção de dados distribuídos em várias páginas
10.9. Extração de dados genômicos da plataforma "My Cancer Genome"
10.10. Extração de informações genéticas do banco de dados HGNC HUGO Gene Nomenclature Committee
10.11. Extração de dados farmacológicos do banco de dados “OncoKG” (Precision Oncology Knowledge Base)

Módulo 11. Novas técnicas na era genômica

11.1. Entendendo a nova tecnologia: Next Generation Sequence (NGS) na prática clínica

11.1.1. Introdução
11.1.2. Antecedentes
11.1.3. Problemas na aplicação do sequenciamento Sanger em Oncologia
11.1.4. Novas técnicas de sequenciamento
11.1.5. Vantagens do uso do NGS na prática clínica
11.1.6. Limitações do uso de NGS na prática clínica
11.1.7. Termos e definições relevantes
11.1.8. Tipos de estudos de acordo com o tamanho e profundidade

11.1.8.1. Genomas
11.1.8.2. Exomas
11.1.8.3. Painéis multigênicos

11.1.9. Etapas no sequenciamento NGS

11.1.9.1. Preparação de amostras e bibliotecas
11.1.9.2. Preparação de templates e sequenciamento
11.1.9.3. Processamento bioinformático

11.1.10. Anotação e classificação de variantes

11.1.10.1. Bases de dados demográficos
11.1.10.2. Bases de dados específicas do local
11.1.10.3. Preditores bioinformáticos de funcionalidade

11.2. Sequenciamento de DNA e análise bioinformática

11.2.1. Introdução
11.2.2. Software
11.2.3. Procedimento

11.2.3.1. Extração de sequências brutas
11.2.3.2. Alinhamento de sequências
11.2.3.3. Refinamento do alinhamento
11.2.3.4. Chamada de variantes
11.2.3.5. Filtragem de variantes

11.3. Sequenciamento de RNA e análise bioinformática

11.3.1. Introdução
11.3.2. Software
11.3.3. Procedimento

11.3.3.1. Avaliação de CQ de dados brutos
11.3.3.2. Filtragem rRNA
11.3.3.3. Dados filtrados de controle de qualidade
11.3.3.4. Corte de qualidade e remoção do adaptador
11.3.3.5. Alinhamento de reads a uma referência
11.3.3.6. Chamada de variantes
11.3.3.7. Análise da expressão gênica diferencial

11.4. Tecnologia ChIP-Seq

11.4.1. Introdução
11.4.2. Software
11.4.3. Procedimento

11.4.3.1. Descrição do conjunto de dados CHiP-Seq
11.4.3.2. Obter informações sobre o experimento utilizando os sites GEO e SRA
11.4.3.3. Controle de qualidade dos dados de sequenciamento
11.4.3.4. Corte e filtragem de reads
11.4.3.5. Visualização de resultados com Integrated Genome Browser (IGV)

11.5. Big Data aplicado à Oncológica Genômica

11.5.1. O processo de análise de dados

11.6. Servidores genômicos e bancos de dados de variantes genéticas

11.6.1. Introdução
11.6.2. Servidores genômicos da web
11.6.3. Arquitetura de servidores genômicos
11.6.4. Recuperação e análise de dados
11.6.5. Personalização

11.7. Anotação de variantes genéticas

11.7.1. Introdução
11.7.2. O que é a chamada de variante?
11.7.3. Entendendo o formato do VCF
11.7.4. Identificadores de variantes
11.7.5. Análise de variantes
11.7.6. Prevendo o efeito da variação na estrutura e função da proteína

Módulo 12. Aplicações da bioinformática na genômica oncológica

12.1. Enriquecimento clínico e farmacológico de variantes gênicas
12.2. Busca massiva de informações genômicas em PubMed
12.3. Busca massiva de informações genômicas em DGIdb
12.4. Busca em massa de ensaios clínicos sobre dados genômicos em Clinical Trials
12.5. Busca de similaridade genética para interpretação de um painel genético ou de um exoma
12.6. Busca massiva de genes relacionados a doenças
12.7. Enrich-Gen: Plataforma de enriquecimento clínico e farmacológico de genes
12.8. O procedimento do relatório genômico na era da oncologia de precisão

Módulo 13. Câncer de mama

13.1. Princípios do câncer de mama

13.1.1. Epidemiologia
13.1.2. Fatores de risco

13.2. Triagem
13.3. Diagnóstico

13.3.1. Apresentação clínica e diagnóstico

13.4. Estadiamento
13.5. Subtipos
13.6. Tratamento da doença luminal

13.6.1. Doença localizada
13.6.2. Doença avançada

13.7. Tratamento da doença HER 2

13.7.1. Doença localizada
13.7.2. Doença avançada

13.8. Tratamento da doença triplo-negativa

13.8.1. Doença localizada
13.8.2. Doença avançada

13.9. Perspectivas futuras para a doença luminal
13.10. Perspectivas futuras para a doença não luminal

Módulo 14. Câncer de pulmão

14.1. Princípios do câncer de pulmão

14.1.1. Epidemiologia
14.1.2. Fatores de risco

14.2. Principais mutações: possíveis alvos
14.3. Diagnóstico
14.4. Estadiamento
14.5. Tratamento do câncer microcítico doença localizada
14.6. Tratamento do câncer microcítico doença estendida
14.7. Tratamento do câncer não microcítico doença localizada
14.8. Tratamento do câncer não microcítico doença avançada

14.8.1. Adenocarcinoma
14.8.2. Carcinoma epidermóide

14.9. Perspectivas futuras
14.10. Prevenção primária

Módulo 15. Tumores otorrinolaringológicos

15.1. Câncer otorrinolaringológico

15.1.1. Epidemiologia
15.1.2. Fatores de risco

15.2. Principais mutações: possíveis alvos
15.3. Diagnóstico
15.4. Estadiamento
15.5. Tratamento de tumores de laringe localizados
15.6. Tratamento de tumores de faringe
15.7. Tratamento de tumores otorrinolaringológicos avançados
15.8. Tratamento de tumores de nasofaringe localizados
15.9. Tratamento de tumores de nasofaringe avançados
15.10. Perspectivas futuras

Módulo 16. Câncer colorretal e de canal anal

16.1. Cólon e canal anal

16.1.1. Epidemiologia
16.1.2. Fatores de risco

16.2. Diagnóstico
16.3. Estadiamento
16.4. Tratamento do câncer de cólon doença localizada
16.5. Tratamento do câncer de reto doença localizada
16.6. Tratamento do câncer colorretal doença avançada
16.7. Tratamento de tumores de canal anal
16.8. Perspectivas futuras
16.9. Triagem
16.10. Síndromes genéticas associadas

Módulo 17. Tumores digestivos não colorretais

17.1. Tumores digestivos não colorretais

17.1.1. Epidemiologia
17.1.2. Fatores de risco

17.2. Diagnóstico
17.3. Estadiamento

17.3.1. Câncer de esôfago
17.3.2. Câncer de estômago
17.3.3. Câncer pancreático

17.4. Câncer de esôfago

17.4.1. Tratamento de doenças localizadas
17.4.2. Tratamento de doença extensiva

17.5. Câncer de estômago

17.5.1. Tratamento de doenças localizadas
17.5.2. Tratamento de doença extensiva

17.6. Câncer pancreático

17.6.1. Tratamento de doenças localizadas
17.6.2. Tratamento de doença extensiva

17.7. Câncer das vias biliares
17.8. Hepatocarcinoma
17.9. Tumores neuroendócrinos
17.10. Perspectivas futuras

Módulo 18. Tumores ginecológicos

18.1. Tumores ginecológicos

18.1.1. Epidemiologia
18.1.2. Fatores de risco

18.2. Diagnóstico
18.3. Estadiamento

18.3.1. Câncer de ovário
18.3.2. Câncer do colo do útero
18.3.3. Câncer de endométrio

18.4. Tratamento de câncer de ovário localizado
18.5. Tratamento de câncer de ovário avançado
18.6. Tratamento de câncer de útero localizado

18.6.1. Cérvix
18.6.2. Endométrio

18.7. Tratamento de câncer de útero avançado

18.7.1. Cérvix
18.7.2. Endométrio

18.8. Sarcomas uterinos
18.9. Síndromes genéticas 
18.10. Perspectivas futuras

Módulo 19. Tumores urológicos

19.1. Evolução

19.1.1. Epidemiologia

19.2. Diagnóstico

19.2.1. Câncer de próstata
19.2.2. Câncer urotelial
19.2.3. Câncer renal
19.2.4. Câncer de testículo

19.3. Estadiamento

19.3.1. Câncer de próstata
19.3.2. Câncer urotelial
19.3.3. Câncer renal

19.4. Tratamento de câncer de próstata localizado
19.5. Tratamento de câncer de próstata avançado
19.6. Tratamento de câncer urotelial localizado
19.7. Tratamento de câncer urotelial avançado
19.8. Tratamento do câncer renal
19.9. Tratamento do câncer testicular
19.10. Câncer peniano

Módulo 20. Sarcomas e melanomas

20.1. Princípios dos tumores mesenquimais
20.2. Diagnóstico de tumores mesenquimais
20.3. Tratamento cirúrgico de tumores ósseos e de tecidos moles
20.4. Tratamento médico de sarcomas

20.4.1. Ósseos
20.4.2. Partes moles

20.5. Tratamento da GIST
20.6. Melanoma
20.7. Diagnóstico e estadiamento de melanomas
20.8. Tratamento de melanoma localizado
20.9. Tratamento de melanoma avançado
20.10. Perspectivas futuras

20.10.1. Tumores ósseos e de tecidos moles
20.10.2. Melanoma

Módulo 21. Tumores cerebrais

21.1. Evolução

21.1.1. Epidemiologia

21.2. Classificação
21.3. Síndromes genéticas associadas
21.4. Fatores prognósticos e preditivos de resposta
21.5. Diagnóstico
21.6. Tratamento de tumores de baixo grau
21.7. Tratamento de tumores de alto grau
21.8. Imunoterapia
21.9. Metástases cerebrais
21.10. Perspectivas futuras

Módulo 22. Radioterapia

22.1. Evolução
22.2. Tipos de radioterapia
22.3. Tratamento do câncer de mama
22.4. Princípios do câncer de pulmão
22.5. Tratamento do câncer de próstata
22.6. Tratamento de tumores digestivos
22.7. Tratamento dos tumores cerebrais
22.8. Tratamento de tumores otorrinolaringológicos
22.9. Tumores orbitais, tumores mediastinais, tumores mesenquimais
22.10. Radioterapia paliativa

Módulo 23. Caracterização e campos de aplicação da psico-oncologia

23.1. O câncer e seu impacto na sociedade atual

23.1.1. Variabilidade cultural
23.1.2. Incidência, prevalência e mortalidade

23.2. Mitos, crenças e pseudoterapias contra o câncer
23.3. Cuidados médicos para pacientes com câncer

23.3.1. Detecção precoce do câncer
23.3.2. Cirurgia e tratamentos

23.4. Fatores de risco e câncer

23.4.1. Psiconeuroimunologia
23.4.2. Estresse, estilos de enfrentamento e variáveis de personalidade

23.5. Prevenção do câncer

23.5.1. Prevenção primária e secundária
23.5.2. Educação em saúde e estilos de vida saudáveis

23.6. Funções do psico-oncologista. Seu papel no ambiente hospitalar
23.7. Ensino, formação, especialização e acreditação em Psico-Oncologia
23.8. Objetivos e áreas de intervenção psicológica em pacientes com câncer e seus familiares
23.9. Outras disciplinas relacionadas com a Psico-Oncologia

23.9.1. A psico-oncologia como intersecção entre a Oncologia e a Psicologia da Saúde

23.10. Atendendo às necessidades sociais de pacientes com câncer

23.10.1. Impacto econômico e trabalhista. Reinserção laboral
23.10.2. Apoio social e câncer

Módulo 24. Tratamentos psicológicos no câncer e terapias de terceira geração

24.1. Tratamentos psicológicos eficazes em psico-oncologia
24.2. Terapia cognitiva-comportamental no tratamento do câncer

24.2.1. Identificação de pensamentos automáticos e modificação de cognições
24.2.2. Técnicas de controle da ativação

24.2.2.1. Treinamento de respiração diafragmática
24.2.2.2. Relaxamento muscular progressivo

24.2.3. Ativação comportamental
24.2.4. Técnicas de exposição e imagens guiadas

24.3. Programa de treinamento cognitivo
24.4. Programa de reabilitação baseado no exercício físico
24.5. Mindfulness ou consciência plena

24.5.1. Programa de treinamento em mindfulness
24.5.2. Prática de compaixão e autocompaixão

24.6. Terapia de aceitação e compromisso (ACT)

24.6.1. Componentes da ACT e métodos clínicos

24.7. Terapia centrada na busca de sentido

24.7.1. Câncer e sentido. Exame das fontes de sentido

24.8. Terapia da dignidade

24.8.1. O conceito de dignidade em pacientes com câncer
24.8.2. Modelos de dignidade. Chochinov

24.9. Terapia familiar sistêmica

24.9.1. Família e câncer Dinâmica familiar mais frequente

24.10. Pseudoterapias e pseudociências contra o câncer

24.10.1. Posições de organizações oficiais
24.10.2. Pseudoterapias e pseudociências com e sem evidência científica

Módulo 25. Aspectos psicológicos mais relevantes de acordo com as diferentes localizações tumorais

25.1. Leucemias, linfomas e mielomas

25.1.1. Transplante de medula óssea e situações de isolamento

25.2. Câncer de mama e ginecológico

25.2.1. Imagem corporal
25.2.2. Sexualidade
25.2.3. Autoestima
25.2.4. Efeito Chemobrain

25.3. Câncer de próstata

25.3.1. Incontinência e impotência sexual

25.4. Câncer de cólon e sistema digestivo

25.4.1. Viver com uma colostomia

25.5. Intervenção em laringectomizados

25.5.1. Intervenção de fonoaudiologia
25.5.2. Alteração da vida social e laboral

25.6. Tumores de cabeça e pescoço
25.7. Câncer de tireoide
25.8. Tumores do sistema nervoso central

25.8.1. Déficits e limites cognitivos e limitações de mobilidade

25.9. Câncer de pulmão
25.10. Câncer infantil

25.10.1. Desenvolvimento emocional e intelectual da criança
25.10.2. Impacto social na criança
25.10.3. Impacto na família

Módulo 26. Protocolos de intervenção emocional no final da vida

26.1. Objetivo dos cuidados paliativos
26.2. A avaliação do sofrimento
26.3. O processo de adaptação psicossocial no final da vida

26.3.1. Reações adaptativas vs. desadaptativas

26.4. Modelo de interação triádica paciente-profissional de saúde-familiar
26.5. Intervenções específicas centradas no paciente

26.5.1. Ansiedade
26.5.2. Tristeza
26.5.3. Hostilidade
26.5.4. Medo
26.5.5. Culpa
26.5.6. Negação
26.5.7. Retraimento

26.6. Necessidades específicas da família. Avaliação da unidade paciente-família

26.6.1. Conspiração do silêncio
26.6.2. Claudicação Familiar

26.7. Intervenções dirigidas aos profissionais de saúde

26.7.1. Trabalho na equipe multidisciplinar
26.7.2. Prevenção da Síndrome de Burnout

26.8. Atenção às necessidades espirituais dos doentes

26.8.1. Modelo de cuidado espiritual da SECPAL
26.8.2. Angústia existencial e experiência religiosa

26.9. Intervenção psicológica em cuidados paliativos pediátricos
26.10. Processo de Tomada de Decisão Avançada e Planejamento (PAD)

26.10.1. Declaração e registro de diretiva antecipada de vontade

Módulo 27. Instrumentos de avaliação e medição

27.1. A entrevista clínica em Psico-Oncologia
27.2. Avaliação das necessidades dos pacientes com câncer

27.2.1. Questionário de avaliação de necessidades
(Needs Evaluation Questionnaire, NEQ)
27.2.2. Instrumento de Avaliação de Necessidades do Paciente (Patient Needs Assessment Tool, PNTA)
27.2.3. Questionário Curto de Necessidades de Câncer (The Short-Form Cancer Needs Questionnaire, CNQ)

27.3. Avaliação da qualidade de vida em enfermos de câncer

27.3.1. Questionário da EORTC (European Organization for Research and Therapy of Cancer)
27.3.2. Questionário FACT (Functional Assessment of Cancer Therapy)
27.3.3. Questionário de Saúde SF-36

27.4. Principais questionários de avaliação de sintomas físicos no câncer

27.4.1. Versão espanhola do Edmonton Symptom Assessment Sytem (ESAS)
27.4.2. Questionários para avaliação da dor
27.4.3. Questionários para avaliação da fadiga e qualidade do sono
27.4.4. Questionários de Screening Cognitivo e Estado Funcional
27.4.5. Questionários para avaliação da sexualidade

27.5. Detecção do desconforto e avaliação do sofrimento

27.5.1. Questionário de Detecção de Angústia Emocional (DME)
27.5.2. Termômetro de angústia emocional
27.5.3. Escala Hospitalar de Ansiedade e Depressão (HAD)
27.5.4. A percepção subjetiva da passagem do tempo

27.5.4.1. Tempos de espera em oncologia

27.6. Avaliação sociofamiliar

27.6.1. Percepção da função familiar. Questionário APGAR familiar
27.6.2. Índice de Relações Familiares (Family Relationship Index, FRI)
27.6.3. Inventário Familiar de Autorrelato (Self report Family Inventory, SFI)

27.7. Questionários de avaliação de enfrentamento em pacientes com câncer

27.7.1. Escala de Ajustamento Mental ao Câncer (Mental Adjustment to Cancer, MAC)
27.7.2. Questionário para medir estilos de enfrentamento. Escala de Estilo Comportamental de Miller (Miller Behavioral Style Scale, MBSS)
27.7.3. Questionário COPE

27.8. Instrumento de Avaliação de Necessidades Espirituais

27.8.1. Escala de avaliação de necessidades e bem-estar espiritual do GES. SECPAL
27.8.2. Teste Propósito na Vida e FACIT-Sp (Functional Assessment of Chronic Illness Therapy Spiritual Well Being)
27.8.3. Escala de Dignidade do Paciente (The Patient Dignity Inventory)

27.9. Autorregistro e observação

27.9.1. Formulação de casos clínicos
27.10. A avaliação psicológica da criança em cuidados paliativos

Módulo 28. Comunicação com o paciente oncológico

28.1. Doença, comunicação e relacionamento de ajuda

28.1.1. Comunicação médico-paciente como possível fator de melhora ou iatrogenia. Prevenção da dor e sofrimento
28.1.2. Obstáculos à comunicação

28.2. Como dar más notícias em câncer

28.2.1. Respostas para perguntas difíceis
28.2.2. Comunicação em situações complicadas

28.3. Técnicas de Counselling na prática clínica

28.3.1. Atitudes de Counselling
28.3.2. Comunicação assertiva
28.3.3. Controle emocional
28.3.4. Solução de problemas e tomada de decisões responsáveis

28.4. Modelos de relacionamento e influência terapêutica

28.4.1. Modelo paternalista
28.4.2. Modelo de relatório
28.4.3. Modelo interpretativo
28.4.4. Modelo deliberativo

28.5. Ferramentas para apoio emocional no câncer

28.5.1. Como falar com um paciente com câncer. Guia para familiares e amigos
28.5.2. Níveis de interação emocional
28.6. Comunicação não-verbal na relação de ajuda

28.7. Comunicação em cuidados paliativos e fim de vida

28.7.1. Aprenda a falar sobre a morte

28.8. Falar sobre câncer a crianças
28.9. Comunicação em pessoas com déficit de comunicação
28.10. Tratamento de câncer na mídia

28.10.1. O câncer nas redes sociais

Módulo 29. Gestão do luto

29.1. Morte, cultura e sociedade

29.1.1. Os profissionais de saúde diante da morte

29.2. Avaliação psicológica do luto

29.2.1. Entrevista e instrumentos específicos de avaliação

29.3. Reações frequentes de luto

29.3.1. Luto normal e luto complicado
29.3.2. Fatores de vulnerabilidade
29.3.3. Diagnóstico diferencial entre luto e depressão

29.4. Principais modelos teóricos sobre o luto

29.4.1. A teoria da ligação de Bowlby
29.4.2. Crenças centrais e reconstrução de significados
29.4.3. Modelos conceituais sobre trauma

29.5. Objetivos da intervenção no luto e intervenções recomendadas

29.5.1. Facilitando o processo normal de luto. Prevenção do luto complicado
29.5.2. Sugestões de intervenção antes e depois da morte
29.5.3. Psicoterapia do luto a partir de um modelo relacional integrativo

29.6. Intervenção em grupo no cuidado do luto

29.6.1. Intervenção psicológica no luto pela perda de um filho

29.7. As etapas do luto

29.7.1. Tarefas de luto

29.8. Luto em crianças

29.9. Suicídio e câncer
29.10. Psicofarmacologia no cuidado do luto

Módulo 30. Outras intervenções psicológicas em áreas específicas relacionadas ao câncer

30.1. Tratamento psicológico para parar de fumar:

30.1.1. mitos sobre o tabaco
30.1.2. Análise do comportamento de fumar. Dependência física e psicológica
30.1.3. Estrutura do programa. Sessões e metodologia
30.1.4. Abstinência e prevenção de recaídas

30.2. Detecção precoce do câncer

30.2.1. Exames de Screening (mamografia, FOB, citologia etc.)
30.2.2. Ansiedade Antecipatória e Dificuldades de Participação
30.2.3. Aconselhamento genético oncológico

30.3. Grupos de ajuda mútua ou de auto-ajuda
30.4. Grupos psicoeducativos para familiares e pacientes

30.4.1. Temas a abordar e metodologia de trabalho
30.4.2. Critérios de inclusão e exclusão

30.5. Intervenção psicológica em sobreviventes de câncer. De volta ao “normal”
30.6. Controle de efeitos colaterais em pacientes com câncer

30.6.1. Controle da dor
30.6.2. Controle da fadiga e do sono
30.6.3. Controle da sexualidade
30.6.4. Alterações cognitivas Efeito Chemobrain

30.7. Preparação e intervenção para internação e cirurgia
30.8. Preparação psicológica para outros tratamentos médicos (quimioterapia, radioterapia etc.)
30.9. Intervenção psicológica no transplante de medula óssea (TMO)
30.10. Estratégias de treinamento o voluntariado no cuidado de pacientes com câncer

30.10.1. A entrevista de voluntários. Atribuição e adequação do voluntário a cada perfil
30.10.2. Treinamento voluntário específico. Tutoria e monitoramento

Módulo 31. Pesquisa em câncer

31.1. Declaração Mundial para a Pesquisa do Câncer
31.2. Metodologia de pesquisa do câncer

31.2.1. Área de Prevenção do Câncer
31.2.2. Area de tratamento de câncer

31.3. Erros mais frequentes de investigação em psico-oncologia
31.4. Passos a seguir para realizar pesquisas em psico-oncologia
31.5. Pesquisa epidemiológica em câncer
31.6. Pesquisa biomédica

31.6.1. Participação em ensaios clínicos em câncer
31.6.2. Dúvidas, riscos e benefícios
31.6.3. Distribuição de ensaios clínicos por tipo de câncer

31.7. Principais avanços na pesquisa

31.7.1. Áreas prioritárias de investigação em psico-oncologia
31.7.2. Áreas prioritárias de investigação em cuidados paliativos
31.7.3. Novas linhas de pesquisa

31.8. Linhas de pesquisa do serviço social
31.9. Publicações sobre psico-oncologia e cuidados paliativos em revistas científicas

31.9.1. A redação de artigos científicos

Módulo 32. Aspectos éticos em psico-oncologia e psicologia dos cuidados paliativos

32.1. Deve-se ou não dizer a verdade ao paciente? Manejo da verdade suportável
32.2. Câncer e ética, uma interação complexa

32.2.1. Bioética principialista
32.2.2. Bioética personalista
32.2.3. Princípio de duplo efeito

32.3. Fundamentos antropológicos

32.3.1. A experiência de fragilidade
32.3.2. A experiência de sofrimento
32.3.3. A pessoa como curador ferido

32.4. Direitos do paciente com câncer

32.4.1. Lei de autonomia do paciente
32.4.2. Consentimento informado
32.4.3. LOPD e confidencialidade dos prontuários médicos

32.5. Deveres éticos dos profissionais de saúde que cuidam de pacientes com câncer
32.6. Morte digna

32.6.1. Suicídio assistido e eutanásia
32.6.2. Adequação ou limitação do tratamento, recusa do tratamento, sedação, obstinação terapêutica

32.7. A participação do paciente em seu processo de doença, tratamento e tomada de decisões

32.7.1. O diálogo moral

32.8. Humanização no cuidado ao paciente com câncer

32.8.1. Qualidade e calidez

32.9. Comitês de ética em saúde e pesquisa clínica
32.10. Desigualdades e equidade contra o câncer

32.10.1. A situação atual dos cuidados paliativos

O programa de estudos oferece uma seleção de leituras complementares, incluindo artigos científicos, revisões e diretrizes clínicas que complementam e expandem o conteúdo teórico do Curso”