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También se muestran las técnicas de laboratorio que se usan en el campo de la nutrición genómica y de precisión, por lo que se presentarán las bases para que el alumno pueda reconocerlas y apreciarlas una vez que esté en un laboratorio. Y se analiza la metodología usada en estudios clínicos humanos, profundizando en los diseños usados principalmente en epidemiologia nutricional. Para ello, se muestra la manera de realizar análisis estadístico de los estudios en grandes poblaciones de nutrición.
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Módulo 1. Introducción a la nutrición genómica y de precisión
1.1. El genoma humano
1.1.1. El descubrimiento del ADN
1.1.2. El año 2001
1.1.3. El proyecto de genoma humano
1.2. Las variaciones que interesan la nutrición
1.2.1. Variaciones genómicas y la búsqueda de genes de enfermedades.
1.2.2. Factor ambiente vs genético y la heredabilidad.
1.2.3. Diferencias entre SNP, mutaciones y CNV.
1.3. El genoma de las enfermedades raras y enfermedades complejas
1.3.1. Ejemplos de enfermedades raras.
1.3.2. Ejemplos de enfermedades complejas.
1.3.3. Genotipo y fenotipo.
1.4. La medicina de precisión
1.4.1. Influencia de la genética y los factores ambientales en las enfermedades complejas.
1.4.2. La necesidad de precisión. El problema de la heredabilidad perdida. El concepto de interacción.
1.5. La nutrición de precisión vs la nutrición comunitaria
1.5.1. Los principios de la epidemiologia nutricional.
1.5.2. Bases actuales de la investigación nutricional.
1.5.3. Diseños experimentales en la nutrición de precisión.
1.6. Niveles de evidencia científica
1.6.1. Pirámide epidemiológica
1.6.2. Regulación.
1.6.3. Guías oficiales
1.7. Consortia y estudios principales en nutrición humana y nutrición genómica
1.7.1 Proyecto Precision4Health
1.7.2. Framingham
1.7.3. PREDIMED
1.7.4. CORDIOPREV
1.8. Estudios Europeos actuales
1.8.1. PREDIMED Plus
1.8.2. NU-AGE
1.8.3. FOOD4me.
1.8.4. EPIC
Módulo 2. Técnicas de laboratorio para la nutrición genómica
2.1. El laboratorio de biología molecular
2.1.1. Instrucciones básicas.
2.1.2. Material básico.
2.1.3. Acreditaciones necesarias en EU.
2.2. Extracción de ADN
2.2.1. De saliva.
2.2.2. De sangre.
2.2.3. De otros tejidos.
2.3. Real-time PCR
2.3.1. Introducción- historia del método.
2.3.2. Protocolos básicos usados.
2.3.3. Equipos más usados.
2.4. Secuenciación
2.4.1. Introducción- historia del método.
2.4.2. Protocolos básicos usados.
2.4.3. Equipos más usados.
2.5. High-throughput
2.5.1. Introducción- historia del método.
2.5.2. Ejemplos de estudios en humanos.
2.6. Expresión génica - Genómica - Transcriptómica
2.6.1. Introducción- historia del método
2.6.2 Microarrays
2.6.3. Tarjetas Microfluidicas
2.6.4. Ejemplos de estudios en humanos
2.7. Tecnologías -omicas y sus biomarcadores
2.7.1. Epigenomica
2.7.2. Proteómica
2.7.3. Metabolómica
2.7.4. Metagenómica
2.8. Análisis bioinformática
2.8.1. Programas y herramientas bioinformáticas pre y post informáticas.
2.8.2. GO terms, Clustering de datos de ADN microarrays
2.8.3. Functional enrichment, GEPAS, Babelomics
Módulo 3. Bioestadística para la nutrición genómica
3.1. Bioestadística.
3.1.1. Metodología de Estudios Humanos
3.1.2. Introducción al diseño experimental.
3.1.3. Estudios clínicos
3.2. Aspectos estadísticos de un protocolo.
3.2.1. Introducción, objetivos, descripción de las variables
3.2.2. Variables cuantitativas
3.2.3. Variables cualitativas
3.3. Diseño de estudios clínicos en humanos, guías metodológicas,
3.3.1. Diseños con 2 tratamientos 2x2
3.3.2. Diseños con 3 tratamientos 3x3
3.3.3. Diseño paralelo, cross-over, adaptativo.
3.3.4. Determinación del tamaño muestral y análisis del poder estadístico
3.4. Evaluación del efecto del tratamiento
3.4.1. Para diseño en paralelo, para medidas repetidas, para diseños cross-over.
3.4.2. Aleatorización del orden de asignación de tratamientos.
3.4.3. Efecto carry-over (wash out).
3.5. Estadística descriptiva, contraste de hipótesis, cálculo de riesgo.
3.5.1. Consort, poblaciones
3.5.2. Poblaciones de un estudio
3.5.3. Grupo control
3.5.4. Análisis de subgrupos tipos de estudios
3.6. Errores estadísticos
3.6.1. Errores de medida
3.6.2. Error aleatorio
3.6.3. Error sistemático
3.7. Sesgos estadísticos
3.7.1. Sesgo de selección
3.7.2. Sesgo de observación
3.7.3. Sesgo de asignación
3.8. Modelización estadística
3.8.1. Modelos para variables continuas
3.8.2. Modelos para variables categóricas
3.8.3. Modelos lineales mixtos
3.8.4. Missing data, flujo de participantes, presentación de resultados.
3.8.5 Ajuste por valores basales, transformación de la variable respuesta: diferencias, ratios, logaritmos, evaluación de carry-over.
3.9. Modelizaciones estadísticas con co-variables
3.9.1. ANCOVA
3.9.2. Regresión logística para variables binarias y de conteo
3.9.3. Análisis multi-variante
3.10. Los programas estadísticos
3.10.1. La R
3.10.2. El SPSS
Módulo 4. El estado de mercado actual
4.1. Aspectos legales
4.2. Aspectos Éticos
4.3. DTC (Direct-to-consumer) Tests
4.3.1. Pros y contras
4.3.2. Mitos de los primeros DTC
4.4. Criterios de calidad de un test nutrigenético
4.4.1. Selección de SNP
4.4.2. Interpretación de resultados
4.4.2. Acreditaciones de laboratorio
4.5. Los profesionales de la salud
4.5.1. Necesidades de formación
4.5.2. Criterios de profesionales que aplican nutrición genómica
4.6. Nutrigenómica en la prensa
4.7. Integración de la evidencia para el consejo nutricional personalizado
4.8. Análisis crítico de la situación actual
4.9. Trabajo de debate
4.10.Conclusiones, uso de la nutrición genómica y de precisión como prevención
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